精准医疗

IBD患者存在个体间异质性、并发症复杂等问题。Gastroenterology上发表的一篇综述文章，讨论了如何将目前对短期治疗应答的关注扩展到整合多组学系统的生物学策略，以进行生物标志物的鉴定及验证，从而实现长期的预后预测；并总结了未来IBD精准医疗的研究重点：改善疾病分类，深入理解疾病自然史，优化队列研究及临床试验的设计，多组学数据、临床资料、环境因素等信息的整合，生物学的机制验证，将精准医疗策略用于临床实践。

IBD中的精准医疗（综述）

IBD 综述精准医疗

Nature子刊：揭示部分IBD患者对治疗不应答的机制

Nature Medicine上发表的一项最新研究结果，发现在部分IBD患者中，溃疡部位表现出中性粒细胞高度浸润、成纤维细胞活化及上皮细胞丢失等病理学特征，而活化的成纤维细胞以依赖于IL-1R信号的方式诱导中性粒细胞的趋化，上述特征与患者对多种疗法（抗TNF、抗整合素、皮质类固醇等）的不应答相关。该研究结果或有助于IBD的精准医疗，并揭示了阻断IL-1信号以治疗IBD的生物学原理。

IBD 研究论文基础研究队列研究成纤维细胞

药物-菌群互作

成都中医药大学：靶向肠道菌群以实现精准医疗（综述）

肠道菌群可能影响药物的疗效与毒性，个体间菌群组成及功能的不同可能导致的药物应答的差异。成都中医药大学的彭成团队在Theranostics上发表的一篇综述文章，详细讨论了以下几个方面：肠道菌群影响药物疗效及毒性的机制、肠道菌群变化导致的药物应答差异、基于肠道菌群的生物标志物用于患者分层及治疗决策、个性化调控肠道菌群以改善药物应答的策略。

药物-菌群互作 Gut microbiota Precision Medicine drug toxicity Drug Efficacy

精准医疗的一大重点就是分析长期内健康个体分子谱的稳定性，Nature Communications近期发表的一项大型的纵向多组学谱整合分析，表明每个人都有独特而稳定的分子谱，这为未来基于健康纵向监测的精准医疗奠定了基础。

Nature子刊：多组学谱长期追踪或助力精准医疗

精准医疗多组学

神经内分泌瘤

Nature Reviews：重新审视胃肠道神经内分泌瘤——走向精准医疗（综述）

过去几年里，胃肠道神经内分泌癌的研究已取得显著进展，最新发表在Nature Reviews Endocrinology的综述旨在更新目前已被证明对该类患者有效的临床管理知识。此外，还讨论了流行病学、细胞生物学和尚未解决的复杂遗传背景的知识更新，并总结了各类最新诊断工具。

神经内分泌瘤精准医疗综述医学研究肿瘤分级

粪菌移植

粪菌移植用于治疗胃肠疾病，如何迈向精准医疗？（评论）

《Genome Medicine》近期发表的评论文章，讨论了粪菌移植（FMT）在临床标准化和精准医疗过程中需要仔细考虑的因素，包括供体和受体的挑选、方案设计和辅助疗法，以及治疗后的监测和随访等，从而提升治疗的成功率。

粪菌移植 Fecal microbiota transplantation Inflammatory bowel diseases Irritable bowel syndrome Precision Medicine

IBD治疗

预测英夫利昔单抗对IBD疗效的潜在生物标志物

部分IBD患者对英夫利昔单抗等抗TNF药物的治疗无应答，目前尚无生物标志物用于鉴定可对抗TNF治疗产生应答的患者。Clinical Gastroenterology and Hepatology上发表的一项前瞻性研究，分离IBD患者治疗前的PBMC并用LPS刺激，发现PBMC产生的TNF水平可以较高的灵敏度及特异性预测患者对英夫利昔单抗的应答。

IBD治疗 biomarker Prognostic Factor outcome efficacy

炎症性关节炎

Nature Reviews：炎症性关节炎中的药物微生物组学（综述）

药物微生物组学是一门新兴学科，关注药物与菌群之间的复杂互作。Nature Reviews Rheumatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了在炎症性关节炎（包括类风湿关节炎、银屑病关节炎及强直性脊柱炎）中，肠道菌群如何通过调节药物的生物利用度、活性及毒性，以影响药物的治疗效果，并讨论了如何将药物微生物组学应用于炎症性关节炎的精准医疗之中。

炎症性关节炎 Drug Therapy microbiota Prognostic markers rheumatoid arthritis

克罗恩病

利用代谢组学预测克罗恩病患者对抗TNF治疗的应答

Journal of Crohn's and Colitis上发表的一项最新研究，对接受了抗TNF治疗的克罗恩病患者的血清/尿液极性代谢产物、血清/粪便脂质、胆汁酸进行分析，鉴定出了多种与患者对抗TNF治疗的应答相关的潜在生物标志物，其中，利用粪便脂质预测患者应答的准确率最高（AUC可达0.94）。

克罗恩病 Crohn’s disease metabolomics microbiota 克罗恩病

IBD是一种复杂的多因素肠道炎症疾病，驱动因素包括遗传、免疫系统等宿主因素及肠道菌群在内的环境因素。二代测序、高通量多组学及分子网络等技术方法极大促进了IBD相关研究，机器学习及系统生物学等数据分析方法的出现为整合并解读IBD中的大数据以促进基础研究的临床转化带来了进一步的突破。来自Gut上发表的一篇综述文章，讨论了如何通过人工智能及系统生物学等大数据分析方法，将IBD患者的临床数据、图像数据及多组学数据进行整合分析以实现精准治疗，以及利用大数据进行IBD相关研究面临的机遇与挑战。

利用大数据实现对IBD的精准医疗（综述）

IBD CROHN'S DISEASE IBD ULCERATIVE COLITIS 大数据

治疗前的状态影响IBD患者接受免疫抑制治疗后的感染风险

感染是IBD患者接受免疫抑制治疗后的常见副反应之一。来自Gastroenterology上发表的一项队列研究结果，发现在校正年龄、并存并及伴随药物治疗等多种因素后，接受抗TNF或免疫调节剂治疗前虚弱的IBD患者，在治疗后的感染风险显著增加。

IBD immunosuppression Side Effect Thiopurine aging

Nature Reviews：如何对IBD患者进行个性化医疗（综述）

目前治疗IBD的药物可分类为多种作用机制，但IBD患者可能对某些药物的治疗无应答。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了各类IBD治疗药物的作用机制，并讨论了如何结合分子内窥镜技术、转录组学、遗传学、肠道菌群分析、免疫应答通路分析等手段，以预测IBD患者对不同治疗药物的应答。

IBD IBD IBD治疗精准医疗

Science子刊：患者来源的类器官预测结直肠癌患者对化疗的应答

目前缺乏预测癌症患者对化疗药物应答的生物标志物。Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，通过培养转移性结直肠癌患者的活检样本，获取患者来源的类器官（PDO），发现PDO可较好地预测患者对于特定化疗药物的应答。

精准医疗精准医疗疗效预测转移性结直肠癌结直肠癌

肝癌

国内团队Cell发文：乙肝相关肝细胞癌患者的蛋白基因组学特征

来自复旦大学中山医院的樊嘉院士团队、中国科学院上海药物研究所的周虎团队及上海生物化学与细胞生物学研究所的高大明团队Cell上发表的一项最新研究，对乙肝相关肝细胞癌患者的基因组学、转录组学、蛋白组学、蛋白磷酸化组学数据进行整合分析，发现基于多组学数据，可将肝癌患者分为3个亚群，不同亚群的患者具有不同的预后情况及潜在治疗靶点。这一研究有望在将来为肝癌的预后判断、分子分型和个性化治疗提供精准指导。

肝癌 AA signature ALDOA CTNNB1 hepaotcellular carcinoma

抗TNF治疗仅对部分回肠克罗恩病患者有效。来自Cell上发表的一项最新研究，利用单细胞测序对回肠克罗恩病患者的病灶进行了分析后发现，一部分患者的病灶中表现出一种独特的细胞模块（特定细胞显著增加），而这种细胞模块的存在与抗TNF治疗的疗效较差相关。

Cell：与抗TNF治疗疗效相关的细胞模块

IBD IBD 回肠克罗恩病精准医疗抗TNF治疗

菌群与药物的互作可影响药物治疗效果，Cell Host and Microbe今年7月刊发的“微生物与药物”专刊中的这篇综述，详细探讨了菌群-药物互作研究领域的进展，以及用于改善药物疗效的菌群干预策略，值得专业人士参考。

利用基因组和转录组，优化结直肠癌精准医疗（综述）

结直肠癌 colorectal cancer Genome next-generation sequencing novel drugs

药物-菌群互作

Cell子刊：精准医疗中的菌群-药物互作（综述）

药物-菌群互作药物微生物组学精准医疗

Th17免疫应答或抑制PD-1单抗治疗大肠癌的效果

约10%的错配修复正常的结直肠癌患者可对PD-1单抗治疗产生应答。Clinical Cancer Research上发表的一项最新研究，对别了错配修复正常的转移性结直肠癌患者的原发肿瘤组织中的基因表达差异，鉴定出10个与PD-1单抗治疗应答相关的基因，发现IL-17信号可能抑制了患者对免疫检查点抑制剂治疗的应答，提示靶向IL-17信号通路或可与免疫检查点抑制剂联用以治疗结直肠癌。

结直肠癌结直肠癌 Th17应答精准医疗错配修复(MMR)

JAMA子刊：转移性结直肠癌患者的错配修复需要多次检测吗？

先前的一项研究中发现，部分对免疫检查点抑制剂不应答的转移性结直肠癌患者可能被错误地检测为错配修复缺陷，因此推荐患者对错配修复状态进行双重检测，以分析是否适合使用免疫检查点抑制剂进行治疗。《JAMA Oncology》上发表的一篇评论文章对此展开了讨论，认为进行多次检测的成本效益可能不高。

精准医疗转移性结直肠癌免疫检查点抑制剂精准医疗 Maude M David

来自《International Journal of Cancer》的研究报告。BRAFV600E突变在转移性结直肠癌中是一个广泛应用的预后指标，但BRAF非V600E突变患者临床症状及重要性还不清楚。该研究主要鉴定了824位不同分期的结直肠癌患者BRAF相关基因型及相关临床症状。

BRAF非V600E突变或可作为结直肠癌预后指标

结直肠癌 BRAFV600E mutation BRAFnon-V600E mutation primary tumor location BRAFV600E突变

Lancet：临床指标+肠道菌群/肠道基因表达，预测小儿结肠炎治疗应答

Lancet上发表的一项队列研究结果，对约400名小儿溃疡性结肠炎患者对标准化治疗的应答进行了评估，发现可结合临床指标及生物学特征（特定肠道细菌丰度、肠道基因表达等），预测患儿对标准化治疗的应答。

精准医疗队列研究精准医疗小儿溃疡性结肠炎 Yan Yu

Cell子刊：KRAS突变驱动结直肠癌中的免疫治疗耐药性

KRAS的G12D突变可对免疫检查点抑制剂治疗产生耐药性，但其机制尚未明确。《Cancer Cell》上发表的一项最新研究发现，该突变可通过抑制2型干扰素调节因子（IRF2），促进骨髓源性抑制细胞（MDSC）向肿瘤微环境中的浸润，从而产生免疫抑制，介导了对免疫检查点抑制剂治疗的耐药性。进一步研究发现，IRF2的表达量越高，结直肠癌患者对PD-1单抗治疗的响应越好，提示KRAS-IRF2轴或可在肿瘤精准医疗中发挥重要作用。

结直肠癌 Colorectal cancer (CRC) KRAS IRF2 CXCL3