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高通量筛选平台
文章数:4篇
技术方法
陈海威等Cell:新技术!绘制人体/菌群代谢物与GPCR的互作图谱
G蛋白偶联受体(GPCR)是人类基因组编码的最大的细胞表面受体家族,能识别源自人体、菌群、饮食和药物的多种类型的配体,并调节人体生理的方方面面。然而GPCR中仍然存在很多未知内源性配体的孤儿受体。Cell最新发表了复旦大学陈海威、耶鲁大学Noah Palm与团队的研究文章,报道了一种高度多路复用的GPCR筛选平台——PRESTO-Salsa。该方法能够以高通量的方式,评估小分子、多肽、蛋白质、细菌培养上清、血清等多种类型的样品对GPCR组(314个GPCR)的活化情况进行检测,且具有样品量需求低的优点。基于该方法,研究者绘制了1041种人体相关代谢物和435个人体共生菌株与GPCR组的互作图谱,并揭示了一种免疫细胞相关的GPCR孤儿受体可被牙周病原体的蛋白酶活化。
技术方法
高通量筛选平台
人类菌群
菌群代谢物
代谢组
肠道菌群体外培养
Nature子刊:可用于高通量菌群靶向药物筛选的体外模型
肠道菌群的体外培养,对于微生物组的转化研究有重要意义。Nature Communications近期发表的一项研究,建立了一种高通量的肠道菌群体外培养模型MiPro,能较好的维持菌群的组成和功能稳定性。结合宏蛋白质组学检测技术,MiPro可作为高通量筛选平台,用于肠道菌群靶向药物的筛选与评价。
肠道菌群体外培养
高通量筛选平台
药物-菌群互作
宏蛋白质组学
Jiang-Ning Hu
工程菌
挖掘细菌中的传感器元件,助力工程菌研发
通过给细菌装入能被特定信号激活的“触发器”开关,搭配记忆回路,能使工程菌成为检测体内特定疾病信号的生物传感器。然而,已知的“触发器”种类有限,大大限制了这种策略的应用。《mSystems》近期发表的一项研究,构建了一个高通量筛选平台,可实现对细菌中已存在的“触发器”元件进行筛选,并成功找到了能感应肠道炎症的“触发器”。该策略可用于发掘细菌中存在的响应其它疾病信号的“触发器”,从而实现用活菌对肠道甚至其它部位疾病的无创诊断。
工程菌
biosensors
synthetic biology
生物传感器
合成生物学
抗菌肽研发
Cell:新一代抗菌肽高效筛选平台
抗菌肽是非常有潜力的新一代抗菌剂,有望用于抗击日益严重的抗生素耐药性问题。本研究开发了一个可用于高通量筛选抗菌肽的平台,对于待筛选的肽链的长度、结构和组成均没有限制,可大大拓展我们对抗菌肽理化结构的认识,对开发新一代抗菌药物具有积极的参考价值,值得专业人士关注。
抗菌肽研发
高通量筛选平台
抗生素耐药性
antibiotic resistance
bacteria