人类菌群

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陈海威等Cell：新技术！绘制人体/菌群代谢物与GPCR的互作图谱

G蛋白偶联受体（GPCR）是人类基因组编码的最大的细胞表面受体家族，能识别源自人体、菌群、饮食和药物的多种类型的配体，并调节人体生理的方方面面。然而GPCR中仍然存在很多未知内源性配体的孤儿受体。Cell最新发表了复旦大学陈海威、耶鲁大学Noah Palm与团队的研究文章，报道了一种高度多路复用的GPCR筛选平台——PRESTO-Salsa。该方法能够以高通量的方式，评估小分子、多肽、蛋白质、细菌培养上清、血清等多种类型的样品对GPCR组（314个GPCR）的活化情况进行检测，且具有样品量需求低的优点。基于该方法，研究者绘制了1041种人体相关代谢物和435个人体共生菌株与GPCR组的互作图谱，并揭示了一种免疫细胞相关的GPCR孤儿受体可被牙周病原体的蛋白酶活化。

技术方法高通量筛选平台人类菌群菌群代谢物代谢组

何彦团队：肠道菌群的衰老轨迹与代谢疾病和年龄相关

衰老是不可抗拒的自然规律，肠道菌群也会伴随年龄增长出现衰老。然而，人类肠道菌群的衰老速度可能不同，出现加速或延迟现象。菌群的衰老轨迹是否可以用作成人代谢疾病的生物标志物呢？针对这一问题，南方医科大学珠江医院何彦教授团队在Gut上发表的一项最新研究揭示，肠道菌群的衰老轨迹可能成为儿童和成人慢性疾病的潜在生物标志物，但应考虑年龄和代谢疾病等因素的影响。

菌群衰老代谢性疾病 Letter 基础研究人类菌群

人类肠道菌群宏基因组测序中DNA提取和文库构建方法的验证和标准化

高通量测序菌群测量方法的验证和标准化是支持人类菌群研究及其工业化的必要条件。该研究旨在建立基于标准的解决方案，以提高基于宏基因组学的人类粪便样本菌群分析的准确性和可重复性。本研究中提供的经验证的DNA提取和文库构建方案和方法学指导，拓展了目前人类粪便菌群宏基因组分析的最佳实践。采纳本研究的实验方法和指南将提高基于宏基因组学的人类菌群研究的准确性和可比性，从而促进基于人类菌群产品的开发和商业化。

人类菌群宏基因组肠道菌群标准化准确性

CID：培养组学的创立者和团队，硕果累累！

这是培养组学的引领者Didier Raoult和团队报告给全世界的重要成绩！利用培养组学这一强大工具，他们培养了许许多多已知和未知的细菌、古细菌、巨型病毒、真菌等等微生物，在2016年发表在Nature Microbiology的震惊菌群界的惊世骇俗研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1045515144）之后，他们系统性报告了团队进展，依然很让人兴奋，特别推荐！

人类菌群培养基因组巨型病毒 16S rRNA基因扩增和测序质谱分析