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准确性
文章数:3篇
SCRuB
Nature子刊:高精度去污方法SCRuB助力微生物组数据分析
基于测序的微生物群落分析方法很容易受到污染,这可能会掩盖生物信号或产生假象。使用对照组进行计算去污染的方法是常规使用的,但不能最佳地利用不同样品的共享信息,也不能处理来自污染或生物材料泄漏到对照组的分类群。近日,哥伦比亚大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究,开发出一种高精度去污方法SCRuB(https://github.com/Shenhav-and-Korem-labs/SCRuB),通过结合多个样品和对照的共享信息,可精确识别和清除污染,值得关注。
SCRuB
去污染工具
研究论文
基础研究
疾病分类
牛津纳米孔测序
Nature子刊:纳米孔测序技术、生物信息学及应用(综述)
2021年11月8日,美国俄亥俄州立大学(Ohio State University)区健辉(Kin Fai Au)研究组在Nature Biotechnology在线发表综述论文Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications,该文章系统全面地回顾总结了纳米孔测序技术的发展历史、技术原理、数据特征、生物信息学分析方法以及广泛的应用, 同时也指出了目前存在的问题。
牛津纳米孔测序
准确性
测序长度
生物信息学分析
人类菌群
人类肠道菌群宏基因组测序中DNA提取和文库构建方法的验证和标准化
高通量测序菌群测量方法的验证和标准化是支持人类菌群研究及其工业化的必要条件。该研究旨在建立基于标准的解决方案,以提高基于宏基因组学的人类粪便样本菌群分析的准确性和可重复性。本研究中提供的经验证的DNA提取和文库构建方案和方法学指导,拓展了目前人类粪便菌群宏基因组分析的最佳实践。采纳本研究的实验方法和指南将提高基于宏基因组学的人类菌群研究的准确性和可比性,从而促进基于人类菌群产品的开发和商业化。
人类菌群
宏基因组
肠道菌群
标准化
准确性