个性化医疗

多组学分析可以揭示健康和疾病状态的人群异质性。肥胖症导致了无数的代谢紊乱，并且是多种慢性病的风险因素。Nature Medicine发表的研究，纳入1277人的队列表型数据，利用包括人类基因组和代谢组学、蛋白质组学、临床实验室测试、肠道微生物组等，采用机器学习来预测BMI，并报告了肥胖症的异质性分子特征。总之，这项研究强调了血液代谢物分析对预测和预防医学的作用。

个性化医疗多组学肥胖

个性化医疗

Nature子刊：以药代为中心创建的数字微生物新资源—AGORA2

人体微生物组会影响各种常用处方药的疗效和安全性，设计结合微生物代谢的精准医学方法需要菌株和高分辨的、可扩展的计算模型。近日，爱尔兰高威大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究，提出了基因组规模代谢重建资源AGORA2（含7302个菌株），用于构建预测性的个性化微生物组模型，能够对药物治疗的工作原理和患者的反应进行计算机模拟，发现药物代谢在个体间存在显著差异，这是由他们自己的微生物群所驱动的。此外，基于AGORA2的计算机模拟能够识别与临床环境中的观察结果相关的单个药物的微生物和代谢过程。总之，该研究表明AGORA2能够分析人-微生物-药物的相互作用，未来可用于精准医疗，值得关注。

个性化医疗药物代谢研究论文基础研究微生物代谢

可穿戴设备

Nature子刊：“NutriTrek”—用于精准营养的可穿戴生物设备

可穿戴电子设备在人们的日常生活中正扮演越来越重要的角色，它能够实时且动态的监测人体健康相关的信号。先前，马萨诸塞大学研究人员开发新设备，让细菌利用汗液发电，为可穿戴设备供能。近日，加州理工学院研究人员在Nature Biomedical Engineering发表最新研究，成功开发了名为“NutriTrek”的可穿戴汗液监测设备，可实现多种代谢物以及营养物分子（包括九种必需氨基酸和维生素）实时监测，且成功地将其应用到了糖尿病、肥胖症、以及COVID-19病人体内支链氨基酸的动态评估。总之，该研究为通过汗液连续、动态、乃至无创监测相关标记物奠定了坚实基础，值得相关人群/临床研究人员关注。

可穿戴设备精准营养研究论文基础研究个性化医疗

微生物组不良事件

微生物组不良事件的挑战与机遇（综述）

在过去的微生物组研究中，人们了解到共生微生物群与药物、辐射和外科手术等医疗干预措施之间的许多不良相互作用。如果我们能改变我们的微生物群来预防这些事件呢？发表在Annual Review of Pharmacology and Toxicology的一篇综述文章，讨论了减轻微生物组不良事件（Microbiome adverse event，MAE）的潜在途径，包括微生物组基因工程等新兴领域的应用。了解和预防微生物组不良事件充满了挑战，这需要数据驱动的方法，包括因果推理、多组分技术分析以及针对不同人群的个性化手段等。

微生物组不良事件 Microbiome engineering adverse drug response metagenomics personalized medicine

药物研发

Nature Outlook：多组学大数据，帮助降低药物研发成本

药物研发通常成本高昂，Nature Outlook肠道菌群专题中，以色列魏茨曼科学研究学院的Eran Segal教授撰写的观点文章提出，整合包括微生物组、基因组、代谢组和蛋白质组等多组学的队列大数据研究，从分子层面对人体表型进行深入解析，将有助于优化药物和干预手段的研发，降低研发成本。

药物研发多组学肠道菌群个性化医疗 Eleonora Duregon

药物-菌群互作

Nature Outlook：药物-微生物组的双向互作

药物与菌群的相互作用是菌群研究的一个新兴热点。近期的一些重量级研究表明，药物与肠道菌群的双向互作对菌群平衡和药物疗效都有不可忽视的作用，是个性化医学中不可或缺的部分。Nature Outlook最新上线的肠道菌群专题文章对此进行了报道，回顾了该领域中的重要发现，并对相关研究者进行了采访，值得关注。

药物-菌群互作个性化医疗 Junqiang Liu Pei Zhang Zhongfan Zheng

克罗恩病

Lancet子刊：克罗恩病的个性化医疗（综述）

IBD患者表现出极高的个体差异性，因此，针对不同患者进行个性化医疗非常重要。The Lancet Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了利用生物标志物对克罗恩病患者进行个性化医疗（包括诊断、对不同治疗的应答、预后及不良事件）的现有研究成果，并讨论了未来如何结合基因、转录组、蛋白组及菌群等因素，预测患者的疾病预后及对不同治疗药物的应答情况。

克罗恩病克罗恩病个性化医疗 PredictSure IBD Eva M Medina-Rodriguez

器官芯片

研究菌群-肠-脑轴的多器官芯片平台

老年痴呆和帕金森病等神经退行性疾病中，肠道菌群可能参与疾病的发生和进展，但目前尚缺少能证实特定菌群成员促进疾病的体外研究模型。Trends in Molecular Medicine近期发表文章，报道了由欧洲研究委员会资助的MINERVA项目，旨在开发一个能用于菌群-肠-脑轴研究的多器官芯片平台，相信会在不远的未来推进神经退行性疾病的个性化医疗研究。

器官芯片菌群-肠-脑轴 microbiota–gut–brain axis Organ-on-a-chip Neurodegeneration

深度学习

Nature子刊：深度学习算法预测微卫星不稳定

胃肠道癌症患者对免疫治疗的应答受到微卫星不稳定的影响。Nature Medicine上发表的一项最新研究，开发了一种深度学习算法，利用HE染色的组织切片，即可较好地预测胃肠道癌症患者的微卫星不稳定，有助于更好地实现个性化肿瘤免疫治疗。

深度学习结直肠癌胃癌个性化医疗肿瘤免疫治疗

结直肠癌

Science子刊：果蝇模型用于个体化结直肠癌治疗

KRAS突变的转移结直肠癌目前缺乏非常有效的治疗方法，《Science advances》近期发表的一项研究，通过对患者的肿瘤样本进行基因组分析，构建携带患者特异的关键肿瘤驱动基因突变的果蝇模型，并用该模型进行药物筛选，取得了不错的疗效，这种方法或可用于相关癌症的个性化疗法研发。

结直肠癌个性化医疗果蝇

结直肠癌

肿瘤突变负荷影响特定结直肠癌患者对免疫检查点抑制剂的应答

《Annals of Oncology》上发表的一项最新研究，发现在高微卫星不稳定性的转移性结直肠癌患者中，肿瘤突变负荷显著影响了患者对免疫检查点抑制剂治疗的客观应答率及无进展生存期。

结直肠癌 tumor mutational burden (TMB) microsatellite instability (MSI) Colorectal cancer (CRC) immunotherapy

肿瘤免疫治疗

上海交大附属胸科医院陆舜：肠道菌群或影响PD-1单抗治疗NSCLC的效果

来自上海交通大学附属胸科医院的陆舜团队在Journal of Thoracic Oncology上发表的一项最新研究，发现在接受PD-1单抗治疗的中国非小细胞肺癌患者中，对治疗产生应答的患者的肠道菌群组成及多样性均与不应答的患者有显著差异。

肿瘤免疫治疗 Advanced non-small cell lung cancer Nivolumab Gut microbiota clinical benefit

肝细胞癌

Cell子刊：抑制mTORC1活化——肝癌精准医疗新方向

β-连环蛋白突变引起的肝癌尚无有效的疗法。来自Cell Metabolism上发表的一项最新研究，发现在β-连环蛋白突变引起的肝细胞癌小鼠模型中，抑制mTORC1信号通路，可显著抑制肿瘤增殖并提高小鼠存活率。

肝细胞癌 mTOR信号肝细胞癌个性化医疗 β-连环蛋白

膳食补充剂

Nature Reviews：发展精准膳食补充剂，必须考虑菌群

个性化医疗和精准营养是近年来医学研究领域的新兴方向，除了个体基因差异，越来越多的研究表明肠道菌群也是不能忽略的重要因素。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期发表的新闻观点文章对近期关于菊粉和丁酸的动物研究进行讨论，再次强调了研发基于菌群和遗传的个性化补充剂的重要性，配图中总结了目前关于短链脂肪酸对神经、炎症、代谢和细胞的影响的研究进展，专业人士别错过。

膳食补充剂个性化医疗菊粉丁酸短链脂肪酸

肠道菌群

Nature子刊：菌群相关个性化医疗，种族和地域因素不容忽视

肠道菌群种族差异地域差异个性化医疗疾病诊断

个性化医疗

Cell子刊：研究益生菌的定殖机制，有助于开发“个性化”菌群疗法

Cell Host and Microbe上发表的一篇评论文章，对Suez等人及Zmora等人最新在Cell上发表的两篇重磅益生菌相关研究发表了观点，作者认为应该深入研究益生菌在体内的定殖机制，有利于未来研发“个性化”的细菌疗法。

个性化医疗益生菌益生菌定殖抗性定殖

个性化医疗

Cell：肿瘤个性化医疗新招——PBMC+肿瘤类器官共培养，产生肿瘤特异性T细胞

个性化医疗 Organoids immunotherapy adoptive cell transfer immune checkpoint blockade

药物微生物组学

傅静远等：药物微生物组学助力个性化医疗（综述）

Protein & Cell中国肠道大会专刊发布荷兰格罗宁根大学傅静远主笔的综述，探讨药物微生物组学的进展，介绍了宿主-菌群-药物互作和饮食因素的影响，提出结合队列研究和体外测试模型，更好的研究这些因素在个体药物反应中的复杂机制，从而促进个性化医疗。

药物微生物组学肠道菌群药物代谢个性化医疗 gut microbiome

系统生物学

疾病中环境-宿主-菌群互作的系统生物学（综述）

环境-宿主机因-菌群间的相互作用，在疾病中有重要作用。Human Molecular Genetics近期发表综述对此进行探讨，讨论了疾病中三者间的作用模式，并提出了一个系统生物学的研究框架，以探索三者间的因果关联和机制。

系统生物学多组学研究个性化医疗环境-宿主-微生物

组学

Nature Reviews：整合多组学方法，助力疾病研究（综述）

各种组学技术的进步，极大的拓展了人们对疾病机制的认知。Nature Reviews Genetics[IF：40.282]近期发表的重磅综述，详细介绍并举例探讨了如何将多组学方法整合应用，以加深对疾病机制、检测和疗法的认知，对基础研究和临床医疗均有参考意义。

组学个性化医疗 Clinical genetics Genetic databases Medical genetics

心血管疾病

Nature子刊：心血管疾病的个性化治疗应考虑哪些因素

随着对心血管疾病机制的研究不断深入，越来越多的因素应被纳入个性化治疗方案的考虑中：患者的遗传因素、血液标记物、炎症状态以及菌群构成。Nature Medicine[IF：29.886]近期发表的社论，围绕这个主题展开探讨，值得阅读参考。

心血管疾病个性化医疗

肥胖

JAMA：对肥胖的个性化防治方案

这是JAMA[IF：44.405]发表的关于更加精准化、个性化防治肥胖的观点文章，提出了靠谱的解决方法，值得中国人好好关注下。

肥胖个性化医疗 Chia-Wei Cheng Wendy L Frankel

个性化医疗

Annual Review：菌群有差异，疗效大不同（综述）

这是由Rob Knight领衔发表在ANNUAL REVIEW OF PHARMACOLOGY AND TOXICOLOGY[IF：12.877]的重要综述，系统性阐述了不同的菌群结构可能对不同治疗方法的影响。年度综述，必须关注！

个性化医疗 Douglas Burrin Lee Call

自身免疫性疾病

TI：如何用数学方法解决免疫学问题？（综述）

这是一篇关于免疫学的综述，但关于系统科学、数据获取、数学建模…等内容，很值得做菌群的人参考，特别推荐给大家。

自身免疫性疾病数学建模个性化医疗 Bernard C Lo Kelly M McNagny

人体微生物组

Cell子刊：在健康和疾病中，如何个体化利用微生物组？

以色列魏兹曼科学研究所的Eran Segal、Eran Elinav和团队的重要综述：① 特别讨论：个性化了解每个人的微生物组成和功能，如何能促进个性化诊断、风险评估、疾病预防、疗法决策和患者随访；② 分析相关领域有什么局限性、误区和挑战；③ 探讨通过营养、益生元、益生菌、代谢产物的干预都有什么办法可以调控微生物组。

人体微生物组个性化健康个性化医疗