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文章数：10篇

Nature子刊：使用Stabl发现稀疏、可靠的组学生物标志物

在临床研究中采用高内涵组学技术，已经产生了大量的候选生物标志物。然而，将这些发现转化为真正的临床生物标志物仍然具有挑战性。近日，斯坦福大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究，开发出强大的机器学习管道，可扩展到多组学整合任务，能够对复杂的预测模型进行生物学解释，测试性能较好，值得关注。

Stabl 机器学习研究论文基础研究生物标志物

德布鲁因图

iMeta：江晓芳等综述德布鲁因图在菌群研究中的应用

高通量测序已经成为菌群研究日益关键的组成部分，基于德布鲁因(de Bruijn) 图的高通量测序数据组装方法的发展，已经成为采用测序作为生物学研究的重要组成部分。来自美国NIH江晓芳团队详细阐述了德布鲁因图在菌群研究中的应用，德布鲁因图在高通量测序数据的处理中发挥了核心作用，依赖于这些数据结构的新工具的快速发展表明，在未来它将继续在生物学研究中发挥重要作用。

德布鲁因图菌群组学

基于组学数据挖掘人肠道菌群中的酶（综述）

肠道菌群可表达大量不同功能的酶，介导菌群代谢物的生成，从而影响宿主生理和健康，但目前人们对于这些酶的研究仍存在大量空白。Trends in Biotechnology近期发表综述，详细总结了基于组学数据（宏基因组、代谢组、转录组、宏转录组等）来挖掘肠道菌群中的酶的研究方法，推荐专业人士参考。

酶数据挖掘组学肠道菌群

厌氧微生物群落推动着自然生物质的降解（综述）

微生物富集、测序和生物信息学方法的出现为破译厌氧微生物群落中的功能并将其用于生物能源和可持续的化学产品提供了新的机会。关键在于尽量减少—或完全消除—与预处理相关的工作，并降低所需的酶负荷。这篇综述介绍了厌氧微生物群落的组成以及它们通过新兴的“组学”技术而获得的酶学策略。并进一步讨论了目前对厌氧菌动态代谢功能的理解及它们相互交织的代谢，并展望了利用厌氧菌群进行木质纤维素生物转化的新策略。

组学厌氧群落碳水化合物活性酶生物信息学 Elizabeth P Neale

Nature Reviews：整合多组学方法，助力疾病研究（综述）

各种组学技术的进步，极大的拓展了人们对疾病机制的认知。Nature Reviews Genetics[IF：40.282]近期发表的重磅综述，详细介绍并举例探讨了如何将多组学方法整合应用，以加深对疾病机制、检测和疗法的认知，对基础研究和临床医疗均有参考意义。

组学个性化医疗 Clinical genetics Genetic databases Medical genetics

Cell子刊：增重或减重期间的综合组学特征

这是Cell Systems[IF：8.406]在近期发表的一篇很有意义的研究，分析了健康志愿者在30天增重、7天体重维持、30天减重的体重变化期间的各种组学特征的变化。这会是很多专业人士所关注的，特别推荐。

组学体重变化 genomics metabolomics Microbiome

TM：了解肠道菌群的功能更重要（必读观点文）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的重要观点文献，提出宏转录组、宏蛋白质组、代谢组等功能组学在促进人类对肠道菌群认知上的重要作用，并介绍相关研究方法的细节，其中的观点、图标都很有指导意义，值得精读。

组学菌群功能 Alba Rodríguez-Nogales Francesca Algieri Julio Gálvez

ATG：组学面临挑战，转化之路依然漫长

一篇IF不高，但值得认真读一读的文献，推荐给大家。

多组学转化医学组学 Heping Wang Yinhu Li

CRNFS：探究益生菌特性的16大技术！

益生菌研究的方法学综述，推荐一看。

益生菌组学分子技术 Andrea Du Toit Andrea Du Toit

通过组学数据进行生物群落特异性分析

① 微生物生态学在近年来飞速发展，海量数据的产生让计算方法成为了科学的瓶颈； ② 现有的分析方法大多是基于针对单基因组方法发展出来的，这样的分析应用于生态系统中时可能导致偏向于真核生物及模式生物的结果； ③ 越来越多生物群落特异性的分析方法被开发出来。

组学生物群落 Xiang-He Lei Xiang-He Lei