prophage

搜索
登录

prophage

文章数：4篇

噬菌体疗法

Cell 子刊：宏基因组数据分析，如何助力噬菌体疗法？

噬菌体疗法是消除肠道有害细菌的高度特异性治疗方法。然而，噬菌体和肠道细菌之间的感染关系尚未完全阐明。Cell Host and Microbe发表的一篇文章，对101个健康日本人的肠道病毒组和细菌组进行了宏基因组分析，鉴定出能特异性控制病原微生物的噬菌体来源抗菌酶。利用抗菌酶干预艰难梭菌感染的小鼠，可以显著提高小鼠的成活率。本研究结果表明，基于宏基因组分析的宿主细菌-噬菌体关联信息，有利于改造噬菌体以消灭病原菌，并为开发各种与肠道菌群失调相关疾病的治疗方法提供借鉴。

噬菌体疗法宏基因组 Bacteriophage metagenome analysis Virome

肠道噬菌体

Cell子刊：饮食影响肠道共生菌产生噬菌体

来自Cell Host and Microbe上的一项最新研究，发现肠道共生菌——罗伊氏乳杆菌可在饮食摄入的刺激下，激活基因组中的前噬菌体，而富含果糖的饮食可通过激活Ack信号通路促进噬菌体的产生。

肠道噬菌体 phage gut symbiont fructose SCFA

逆转录因子驱动噬菌体多样性

产生多样性的逆转录因子（DGR）是一种基因盒，可选择性突变噬菌体基因组，产生高突变蛋白。《Microbiome》近期发表研究，报道了新发现的92个DGR，发现其中一种含有DGR的拟杆菌噬菌体广泛分布于共生菌群中，指出DGR的基因突变功能很可能介导了菌群中噬菌体-细菌互作，对于研究病毒组、病毒-细菌互作具有参考价值。

噬菌体噬菌体-病毒互作 Bacteroides Diversity-generating retroelements prophage

TM：序列保守性是否为生物学功能提供了证据？

① 找到一个基因的净化选择（purifying selection）特征，通常被解释为基因功能作为自然选择的靶点；② 本文的观点提供了一种不同的假说：净化选择可能是由于除去群体中的有害突变；③ 有害突变产生的蛋白可能干扰了转录机器，也可能错误折叠成有毒性的蛋白；④ 表达的基因可能经历与其功能状态无关的净化选择。

dN/dS gene transfer agents phage domestication prophage purifying selection