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多糖利用位点
文章数:12篇
甘露聚糖
甘露聚糖对宿主健康和代谢的影响(综述)
在人类肠道菌群(HGM)中,拟杆菌门和厚壁菌门作为优势菌门,主要依靠聚糖进行消化以满足其能量需求。甘露聚糖是人类饮食中不可或缺的一种聚糖,除了能影响人体健康外,其结构的多样性和复杂性还具有改变某些拟杆菌门和厚壁菌门中特定基因簇表达的分子特征。近期发表在Biotechnology Advances上的研究,简述了甘露聚糖的结构多样性和HGM中细菌如何选择甘露聚糖,以及甘露聚糖对宿主健康和代谢的影响。
甘露聚糖
肠菌代谢
综述
拟杆菌门
厚壁菌门
CAZymes
Nature Reviews:肠道菌群中的碳水化合物活性酶(综述)
肠道菌群基因组的很大一部分用于碳水化合物的摄取和降解,表明了这类分子的重要性。碳水化合物的功能不仅是作为这些细菌的碳源,也是附着于宿主的一种方式,以及宿主感染的一种屏障。发表在Nature Reviews Microbiology上的这篇综述,重点介绍了碳水化合物活性酶(CAZymes)的多样性、肠道微生物如何利用它们降解碳水化合物、这些CAZymes的不同化学机制,以及这些微生物及其CAZymes在人类健康和疾病中的作用,促进了人们对CAZymes和聚糖基本作用的理解。
CAZymes
肠道微生物
多糖利用位点
天然朴啉
Nature子刊:肠道菌协同作用消化藻类多糖
天然朴啉是由朴啉和琼脂糖组成复杂的硫酸多糖成分,是很多可食用藻类的重要组分。对于这类特殊碳源,肠道菌群进化出特殊的类群和构成以实现对其的利用。尽管目前人们对于细菌降解硫酸多糖已经有了一定的认识,但具体的机制和途径仍不清楚。近期一篇发表在Nature子刊Nature Chemical Biology上的研究工作,以降解紫菜多糖的拟杆菌(B. plebeius)和降解琼脂糖的单形拟杆菌(B. uniformis)两种肠道共生菌为模型,对其多糖利用位点进行分析,发现并研究了构成解聚包含朴啉和琼脂糖的代谢循环。这些研究成果揭示了肠道菌群降解利用藻类复杂多糖的分子机制,并探究了在利用罕见碳源中,肠道微生物之间的竞争和合作关系。
天然朴啉
朴啉
琼脂糖
藻硫酸多糖
B. plebeius
普雷沃氏菌
Cell子刊:未知肠道普氏菌种的发现与解密——多糖利用能力越高,竞争力越强?
普雷沃特氏菌(Prevotella)具有菌种多样性,是人类肠道中的优势菌属,特别是在饮食富含蔬菜的人群中。Cell Host & Microbe发表文章揭示了小鼠肠道菌群中尚未定义的Prevotella菌种,并阐述了它们是如何‘干掉’同属其它菌株,最大化竞争优势。其中至少三个关键菌株被成功分离、复活,基因测序纳入数据库,为后续研究提供更多可能性。
普雷沃氏菌
多糖利用位点
Prevotella spp
. diet
competition
IgA
肠道IgA调控肠道共生菌群生长的机制
肠道IgA结合菌群抗原后的功能效应尚未明确。来自mBio上发表的一项最新研究,揭示了肠道IgA调控肠道共生细菌生长的一种机制:多形拟杆菌的定殖可诱导特异性IgA应答,后者可靶向多形拟杆菌的果聚糖利用相关蛋白,以抑制多形拟杆菌对果聚糖的利用。
IgA
Bacteroides thetaiotaomicron
immunoglobulin A
Diet
Fructan
瘤胃菌群
发掘骆驼瘤胃中的微生物功能基因
瘤胃菌群中特有的多糖降解基因,最近受到了持续曝光。物种包括牛、羊、驼等各类反刍动物(http://www.mr-gut.cn/home/search?query=%E7%98%A4%E8%83%83)。
瘤胃菌群
骆驼
木质纤维素酶
宏基因组
多糖利用位点
多形拟杆菌
Nature子刊:多形拟杆菌的多糖利用位点如何协同合作降解果胶?
这是近期Nature Microbiology上对之前在同一刊物发表的文章(http://www.xunludkp.com/papers/read/1063071660)的新闻评论,对多形拟杆菌降解果胶的机制进行了介绍,配图是文章精华所在,略显复杂,但值得一看。
多形拟杆菌
多糖利用位点
Heather Paul
Raylene A Reimer
拟杆菌属
Nature子刊:多形拟杆菌是怎样降解果胶多糖的?
这是Nature Microbiology发表的关于人体结肠拟杆菌属降解复杂的果胶多糖的机制研究,这是益生元代谢相关分子机制研究的代表作,值得特别关注。
拟杆菌属
果胶多糖
多糖利用位点
多形拟杆菌
底物偏好
mBio:不同的多糖利用偏好,促进不同肠道细菌的共生
这是对同期发表的研究论文(http://www.xunludkp.com/papers/read/1041836960)的简要介绍,没有图,但仍然值得按老规矩好好读一读。
底物偏好
多糖利用位点
多糖利用偏好
Bacteroides
community diversity
多糖利用位点
mBio:竞争环境下,肠道细菌表现出不同的多糖利用偏好
这是一项实验室培养基环境下研究不同肠道细菌对多糖偏爱性的研究,很值得看看,这个对未来更加深入理解肠道菌群对不同营养物质的利用以及在肠道环境中的pk具有启发意义。特别推荐。
多糖利用位点
卵形拟杆菌
多形拟杆菌
多糖利用偏好
拟杆菌属
TM:拟杆菌如何利用多糖?(综述)
这是一篇重要的关于拟杆菌如何利用多糖的综述,系统性总结了相关研究,深入到了拟杆菌的基因组进行相关研究,这很值得一读!
拟杆菌属
多糖利用位点
多糖利用位点
Nature:控制肠道拟杆菌定殖的关键基因
这是2013年发表在Nature上关于共生细菌定殖因子决定脆弱拟杆菌能否稳定定殖于肠道的重要研究,针对肠道特定细菌的定殖行为机制做了细致研究。经典,必读哦。
多糖利用位点
细菌定殖
脆弱拟杆菌