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Mutation
文章数:4篇
结直肠癌
深度学习助力结直肠癌微卫星不稳定性的临床分级
微卫星不稳定性(MSI)和错配修复缺陷(dMMR)可对结直肠癌患者进行分类,选择不同的治疗策略。深度学习可在常规组织切片上检测肿瘤样品的MSI和dMMR状态,比分子分析更快、更便宜。Gastroenterology近期发表的文章,研发出利用结直肠癌患者的H&E切片检测MSI和dMMR的深度学习算法,在测试集中表现非常优秀,或可用于结直肠癌组织标本的高通量、低成本评估。
结直肠癌
biomarker
Cancer Immunotherapy
Lynch Syndrome
Mutation
胃癌
南京医科大学:中国人群胃癌易感基因分析
为综合描述中国胃癌易感基因特征,南京医科大学靳光付团队在Gut上最新发表研究,荟萃分析了四个全基因组关联研究,结合其他五项研究,共分析了中国人群中10806例胃癌及13749例对照。通过靶向测序、功能注释、体内外实验等方式,破解了5p13.1和10q23.33位点的基因突变影响胃癌发生发展的机制。
胃癌
gene regulation
Genetics
Mutation
stomach cancer
肺癌
吸烟、TP53突变、肺部菌群之间的互作影响肺癌发生
Genome Biology上发表的一项最新研究,对肺癌患者的肺部菌群、TP53基因突变、吸烟之间的互作进行了分析,发现在TP53突变或吸烟的鳞状细胞癌患者中,肺部菌群发生了相似的特定变化,提示环境因素(吸烟)、遗传因素(TP53)、肺部菌群之间的互作可能与肺癌发生相关。
肺癌
lung cancer
Microbiome
Mutation
squamous cell carcinoma
全基因组关联研究(GWAS)
TLL1变异体与丙肝感染相关性肝癌
① 从2007年至2015年,收集457例干扰素为基础的方案治疗的慢性HCV感染SVR日本患者的遗传学DNA,进行全基因组关联研究(GWAS),对486例日本患者构成的独立数据集的79个候选单核苷酸多态性(SNPs)进行复制分析;② 鉴定出位于4号染色体tolloid样1基因(TLL1)内含子中的SNP rs17047200和慢性HCV感染治疗后SVR的患者HCC发展之间的相关性;③ 与对照组相比,肝损伤的啮齿类模型以及纤维化患者肝组织中Tll1/TLL1 mRNA水平增加。
全基因组关联研究(GWAS)
丙肝病毒(HCV)
持续病毒学缓解(SVR)
肝细胞癌(HCC)
单核苷酸多态性(SNPs)