Genetics

肠道运动肠易激综合征 gut motility GWAS SNP

遗传-菌群互作 Genetic association study Genetics genome-wide association studies INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

前期研究发现，自闭症谱系障碍（ASD）患儿的肠道IgA水平显著升高，且肠道菌群发生改变。复旦大学附属儿科医院王明帮、周文浩和德宏州人民医院Zhaoqing Yin与团队，在Computational and Structural Biotechnology Journal上发表的一项最新研究，发现ASD患儿与正常儿童的毒力因子相关肠道菌群（VFGM）基因的组成及多样性有显著差异，结合VFGM基因多样性、肠道IgA水平及特定VFGM基因的丰度开发机器学习算法，可准确区分ASD患儿及正常儿童。

自闭症谱系障碍机器学习毒力因子 IgA 研究论文

IBD

IBD患者的血栓性疾病风险

IBD患者的最大死亡原因是血栓栓塞性疾病（TED）。来自Gastroenterology上发表的一项队列研究结果，通过全外显子组测序及全基因组基因分型，发现约有1/7的IBD患者的TED遗传风险较高，且TED遗传风险与TED病史显著相关。

IBD Genetics Inflammatory bowel diseases Thrombosis 研究论文

多发性硬化

宿主遗传与肠道菌群的互作，决定对多发性硬化的易感性

多发性硬化（MS）是一种中枢神经系统的自身免疫疾病，其发病风险由遗传和环境等因素共同决定，肠道菌群也被证明与MS有密切关系。PNAS近期发表的一项小鼠研究表明，宿主基因型和肠道菌群之间的复杂互作，决定了宿主对MS的易感性。该研究发现，在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中，肠道菌群与宿主的遗传背景之间存在“适配”关系，当菌群与宿主遗传“不匹配”时，抗病个体的菌群或其中的特定肠菌（比如本研究中的罗伊氏乳杆菌），可能反而会增加易病个体的疾病风险。因此，干预肠道菌群治疗自身免疫疾病时，应考虑个体的遗传因素，设计量身定制的治疗方案。

多发性硬化 multiple sclerosis gut microbiome Genetics 实验性自身免疫性脑脊髓炎

胆汁酸

傅静远等：遗传和菌群与肥胖者的胆汁酸的关系

胆汁酸 bile acids Genetics gut microbiome Liver

小麦营养品质

Nature 子刊: 基因工程方法改善小麦营养品质

小麦是全球可食用的三大谷物之一。其主要的营养成分是碳水化合物，包括淀粉和膳食纤维。但是以小麦为原料的精面粉加工食物，容易造成肥胖等慢性疾病。本文论述了小麦淀粉和膳食纤维的组成、结构、代谢等特点，提出可以采用基因工程等方法诱导其淀粉变异、增加膳食纤维含量，以此来改善小麦营养品质，提高小麦面粉基食物的健康价值。

小麦营养品质 biochemistry Biotechnology Diseases Gastroenterology

ABCG5/8

饮食胆固醇和植物甾醇或增加冠心病风险

ABCG5/8基因是影响肠道吸收甾醇的关键调节因子。European Heart Journal近期发表的文章，利用冰岛、丹麦和英国3个国家的生物数据库探讨膳食胆固醇和植物甾醇吸收的变异性是否影响冠心病的风险。发现胆固醇吸收的遗传变异影响非高密度脂蛋白胆固醇水平和冠心病风险，饮食胆固醇和植物甾醇可直接促进动脉粥样硬化的发生。

ABCG5/8 膳食胆固醇植物甾醇吸收 dietary cholesterol

饲料转化效率

肠道菌群组成影响猪的饲料转化效率

饲料效率是猪肉生产中一个至关重要的参数，而肠道菌群对营养物质的消化率起着至关重要的作用，或影响饲料效率。最新发表在Microbiome的研究对3个主要家养猪品种的饲料效率、肥厚特性和肠道微生物组组成进行研究，探讨饲料效率和肠道菌群组成之间的可能联系。

饲料转化效率 Swine Microbiome Genetics performance

尿道微生物组

Cell子刊：宿主遗传和环境影响大龄女性的尿道菌群

尿道菌群随性别而变化，且在老年人群中与发病率有关。Cell Host and Microbe近期发表的文章，对1600位45岁以上女性双胞胎进行尿道菌群分析，发现尿道菌群具有独特组成，且宿主遗传和宿主环境影响尿道菌群组成。

尿道微生物组 Microbiome Genetics urogenital tract Ageing

胰腺癌

Cell子刊：膳食糖、脂肪和蛋白质对胰腺癌易感性的影响

《Cell Reports》发表的一项最新研究中，研究者结合小鼠实验和队列分析，探究了饮食与胰腺癌之间的互作关联，揭示了不同膳食成分对胰腺癌发生、生长和死亡率的复杂影响，鉴定出膳食糖与细胞周期检查点基因MAD2L1之间的互作关系在胰腺癌易感性中的作用，以及膳食植物脂肪的潜在保护性作用。这些发现或能帮助开发鉴定胰腺癌风险人群的筛查方法，并提示调节饮食或有助于胰腺癌的预防和治疗。

胰腺癌饮食成分 pancreatic cancer Diet Genetics

微生物组全基因组关联分析

Nature子刊：遗传与肠道菌群特征的新关联

遗传是影响微生物组的因素之一，但目前人们对这一领域的认识仍很有限。《Nature Microbiology》发表的一项最新研究，在1个比利时队列和2个德国队列中进行了微生物组全基因组关联分析，鉴定出多个菌群与宿主遗传之间的新关联，并用孟德尔随机化方法分析了特定肠道菌与疾病表型的潜在因果关系，推荐专业人士关注。

微生物组全基因组关联分析 Genetics Microbiome Quantitative trait 宿主-菌群互作

全基因组关联分析（GWAS）

23.5万人的全基因组关联分析，揭示营养与健康的关系

文章纳入23.5万多名欧洲血统的人，基于三大营养素和糖的摄入，以及机体体征特点，进行全基因组关联分析（GWAS）。研究结果显示，不同营养素摄入与特定单核苷酸多态性（SNPs）显著相关。并且，脂质、蛋白质、碳水化合物和糖均对机体特点、相关慢性疾病等有正向或者反向相关性。尤其蛋白质的相对摄入与机体代谢功能障碍具有较强相关。由此可见膳食结构对健康的重要性。

全基因组关联分析（GWAS） Diseases Genetics 膳食脂肪膳食碳水化合物

衰老

Nature 子刊：线粒体解偶联或可延长果蝇寿命，促进果蝇肠道稳态

Nature Communications发表的研究表明，果蝇生物钟调节因子（Per和Tim）的丧失，显著延长了果蝇寿命。这种寿命的延长是由于内源性线粒体解偶联蛋白(mitochondrial uncoupling protein, UCP) UCP4C的上调，特别是在肠道中的表达上调介导的。Per的缺失或UCP4C的上调可改善与年龄相关的肠道稳态。另外，给果蝇喂食低剂量解偶联药物，能延长果蝇寿命、促进果蝇肠道稳态。本结果表明，昼夜节律调控的肠道线粒体解耦联能调节果蝇的寿命，并为抗衰老治疗提供潜在靶点。

衰老线粒体 Ageing circadian rhythms Genetics

结直肠癌

4种分子标志物，或可预测大肠癌患者生存期

结直肠肿瘤之间的异质性可能源于发育途径的差异，并可能与患者的生存时间有关。最新发表于Gastroenterology的一项研究探索了不同亚型结直肠癌的标志物与患者生存的关系。该研究发现由4种常见肿瘤标志物组合而成的肿瘤亚型与患者生存时间的差异有关。该研究提示，结直肠肿瘤亚型或可用于确定患者的预后。

结直肠癌 CRC mortality Genetics epigenetic

IBD

小儿IBD中疾病相关的罕见单基因突变

来自Gastroenterology上发表的一项最新研究，在1000多名IBD患儿中鉴定出40个IBD相关的罕见突变（仅在31名患儿中发现，存在于21个先前发现的IBD相关基因中），携带这些突变的患儿表现出发病更早，以及更高的自身免疫病家族史、肠外症状及手术风险，而通过异体造血干细胞移植可能改善携带这些单基因突变的患儿的症状。

IBD IBD Genetics monogenic disease pediatric

肥胖

从双胞胎和基因研究的角度看肥胖与饮食行为

Neuroscience and Biobehavioral Reviews 的这篇文章通过回顾家庭实验（收养vs亲生）、双胞胎实验（同卵vs异卵）和全基因组关联性研究的结果证明了其假设：肥胖应属于遗传效应强的神经行为疾病，其很大程度上受饮食行为的调节且对宏观环境敏感。编者补充段科普正文几点：1）BMI的遗传力随年龄变化而变化，其中环境因素（如幼儿期父母规定饮食而少年期更独立）参与其中；2）被领养孩子的BMI与领养家庭和亲生父母的BMI均相关，证明了环境因素对BMI的影响；3）青春期后至成年期时的性别差异可影响BMI，但性别差异对饮食行为的影响仍未知。总之，尽管饮食行为在肥胖中起重要作用，但其是否参与遗传和环境因素导致的肥胖还需更多的直接证据。

肥胖饮食行为 Twins Genetics Obesity

食管癌

循环肿瘤DNA预测食管癌进展

新辅助放化疗（CRT）加手术是治疗局限性食管癌（ESCA）的标准方法，与单纯食管癌切除术相比，CRT能提高总生存率。但是，接受CRT和手术治疗的患者中有相当一部分最终会进展；此外，对于那些对CRT有良好前期反应的ESCA患者，手术可能不会提供额外的生存益处，说明可能需要一种更为积极的监测方法。传统的临床评估和成像技术，如内窥镜、内窥镜超声、计算机断层扫描和磁共振成像，尚不足以独立衡量患者对CRT的反应。分析治疗后的循环肿瘤DNA（ctDNA）可在多个癌种中检测微小残留疾病（MRD），对局限性鳞状ESCA患者的初步研究表明，对ctDNA或总的无细胞DNA分析是可行的。发表在Gastroenterology的一项最新研究，纳入45位食管癌患者和40位健康对照，收集和分析放化疗前后血清循环DNA、白细胞DNA、食道、胃、十二指肠镜检查期间收集的食管肿瘤活检固定样本，表明ctDNA可用来鉴定肿瘤进展风险最高的患者，具有临床参考价值。

食管癌 Genetics polymorphism chemoradiotherapy SNP

人肠道菌群

Nature子刊：人体肠道菌群研究再添重要资源

肠道菌群研究的下个阶段，将在菌株水平分析肠道菌对宿主健康的作用机制。Nature Medicine发表的最新研究，介绍了一个大型的人肠道菌群资源库BIO-ML，不仅包含近8000个肠道菌分离株和3600多个菌株的基因组序列，还包括80多人的多组学纵向数据，为研究肠道菌群动态和机制再添有力资源。

人肠道菌群 Microbial communities Genetics Genome genomics

胃癌

南京医科大学：中国人群胃癌易感基因分析

为综合描述中国胃癌易感基因特征，南京医科大学靳光付团队在Gut上最新发表研究，荟萃分析了四个全基因组关联研究，结合其他五项研究，共分析了中国人群中10806例胃癌及13749例对照。通过靶向测序、功能注释、体内外实验等方式，破解了5p13.1和10q23.33位点的基因突变影响胃癌发生发展的机制。

胃癌 gene regulation Genetics Mutation stomach cancer

人群肠道菌群结构

非洲农村地区人群的肠道菌群结构

Genome Biology上发表的一项最新研究，对博茨瓦纳和坦桑尼亚的农村地区人群的肠道菌群结构进行了分析，并与工业化地区人群进行了对比。

人群肠道菌群结构 adaptation Agropastoralists Diet Genetics

小肠菌群

以FXR为靶改变胆汁酸合成，可调控小肠菌群

小肠在人体生理中有重要作用，但小肠菌群的研究一直比较缺乏。近期Gastroenterology上线一项人体+小鼠研究，表明用胆汁酸类似物奥贝胆酸（OCA）激活胆汁酸受体FXR，可抑制内源性胆汁酸合成，从而影响小肠菌群的组成。该研究为开发小肠菌群标志物、精准调控小肠菌群用于疾病防治，提供了新思路。

小肠菌群 gene regulation Genetics Metabolism nuclear hormone receptor

遗传关联研究

Nature：对菌群的影响，环境大于宿主基因！

# Nature再发菌群分析强文！# 宿主的遗传背景对人类肠道菌群的影响程度一直不甚明了。Nature杂志（IF:40.137）最新发布了以色列魏茨曼科学研究所Eran Elinav & Eran Sega课题组的研究成果，通过一系列遗传学和统计学相关性分析，指出环境因素比宿主基因对肠道菌群结构的影响更加显著，开创性地将“菌群相关性系数（microbiome-association index）”纳入计算模型，利用肠道菌群数据提高对血糖、肥胖等体质特征的预测精度。作者还鲜明提出，通过菌群来改善治疗效果，无须考虑太多宿主遗传背景，可针对人群特征推动。这篇文献具有较强的研究和应用参考价值，非常值得认真看看，特别推荐给大家。

遗传关联研究人类遗传学人肠道菌群 Genetic association study Genetics

蔗糖酶

Gut：与IBS风险增加相关的蔗糖酶-异麦芽糖酶基因突变

这是Gut[IF：16.658]发表的关于肠易激综合征（IBS）中的特定基因突变的研究，发现蔗糖酶-异麦芽糖酶基因突变或与IBS的风险增加有关。很值得专业人士特别关注。

蔗糖酶异麦芽糖酶肠易激综合征 Diarrhoea Genetics

多发性硬化

Neurotherapeutics：肠道菌群在多发性硬化中的作用（综述）

这是Neurotherapeutics[IF：5.166]发表的关于肠道菌群与多发性硬化之关联的综述，干货很多，值得精读。

多发性硬化 B cells gut microbiome consortia Dysbiosis

瘤胃菌群

mBio：可遗传的奶牛瘤胃菌群与能量获取效率相关

这是一项重要的瘤胃菌群研究，揭示了瘤胃菌群的可遗传性及其在瘤胃生态系统中的关键作用。很值得关注，特别推荐！

瘤胃菌群 Genetics host-microbe interaction microbial ecology Microbiome

2型糖尿病

Diabetologia：肠道菌群作为2型糖尿病的防治靶点（综述）

想知道肠道菌群和2型糖尿病关联的人，好好读这篇文章就够了！

2型糖尿病 16S sequencing Faecal microbiome Genetics Glycaemic control