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文章数：11篇

肠道菌群与动物体型大小的关系

伯格曼法则是指，同一种类的恒温动物的体型会随着生活地区纬度或海拔的增高而变大，也就是说在寒冷环境中的个体通常会有较大的体型。《Molecular Ecology》发表的一项研究在野生小鼠中，探究了肠道菌群与伯格曼法则的关系，未来或能通过粪菌移植实验来研究菌群是否能影响个体的体型。

体重 Mus musculus Microbiome adaptation body size

老年小鼠肠道中的大肠杆菌如何进化？

肠道微生物在衰老过程中起着重要作用。Current Biology最近的研究表明，大肠杆菌在老年小鼠和年轻小鼠中均发生进化。然而，在老年小鼠中，大肠杆菌新陈代谢的适应出现得更慢，并表现出明显的与压力相关的基因突变，即与毒性相关的基因iscR和lrhA。本研究结果提示，衰老或给哺乳动物肠道微生物进化施加了一个选择压力。

衰老肠道菌群大肠杆菌进化 Microbiome

吲哚对肠道细菌的双相趋化作用

菌群在肠道内的空间分布，受到细菌对肠内代谢物的趋化性的影响。PNAS近期发表的一项研究表明，大肠杆菌对肠道内的代谢物吲哚的趋化反应是双相的，可能影响了细菌在肠道内的空间分布。

趋化性吲哚 adaptation chemoreceptors flagella

可移动遗传元件

Cell子刊：用MGEfinder分析细菌中的可移动遗传元件

细菌的演化主要通过DNA突变和可移动遗传元件（MGE）的转移，《Cell Host and Microbe》发表的这项研究介绍了一个用于分析MGE的生信工具MGEfinder，并用其分析了9种细菌病原体，为MGE如何影响抗生素耐药性、毒力和致病性提供了新见解。

可移动遗传元件 Mobile genetic elements transposable elements bacteria Pathogen

甜味剂可影响肠道菌群（综述）

糖的摄入已成为西方饮食的重点，与蔗糖有关的成本和健康问题促进了其他糖和甜味剂的开发和消费。Advances in Nutrition发表的一篇综述，探讨了膳食糖和甜味剂对肠道菌群的影响。作者提出，肠道菌群对糖和甜味剂做出的改变，使其具有不同的代谢和遗传概貌。可以采用一些新型技术来探究这些变化对宿主的影响，从而评估膳食糖和甜味剂的安全性。

膳食糖 dietary sugars artificial sweeteners gut microbiome evolution

微生物生态学

Cell：PopCOGenT新方法鉴定微生物基因组间的基因流动

2001年人类基因组发布后，进入了后基因组时代，开展人类基因组的多角度挖掘，伴随着一系列的方法和软件的开发，实现了更多研究问题的手段。近年来微生物组研究也积累了大量数据，以人类微生物组计划公布的数据为基础，大家可以将之前很多想法付诸实践。近期Cell就有多篇基于HMP数据挖掘的文章，如本周内同期发表的《Cell：20种宏基因组学物种分类工具大比拼》（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1033790381）、《Cell：挖掘人体菌群中不为人知的小蛋白》（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1056603186）。本文是又一篇基于人类微生物组数据挖掘并开发方法的Cell文章，套路值得学习，软件值得跟进和使用。

微生物生态学 Reverse ecology microbial ecology Population structure population genomics

人群肠道菌群结构

非洲农村地区人群的肠道菌群结构

Genome Biology上发表的一项最新研究，对博茨瓦纳和坦桑尼亚的农村地区人群的肠道菌群结构进行了分析，并与工业化地区人群进行了对比。

人群肠道菌群结构 adaptation Agropastoralists Diet Genetics

沙门氏菌如何在宿主内进化（综述）

沙门氏菌感染可导致腹泻，病症可轻微也可能危及生命。这种细菌病原体包括极其多样的致病变种，从宿主特异性到疾病程度存在很大差别。Trends in Microbiology近期发表综述，阐述了沙门氏菌在宿主内进化的机制，值得专业人士关注。

沙门氏菌进化 salmonella evolution Pathogenesis

Microbiome：瘤胃菌群移植如何改变受体肉牛的瘤胃菌群

来自加拿大阿尔伯塔大学的华人团队的研究，对瘤胃内容物移植如何影响受体肉牛的瘤胃菌群进行了分析，对改善肉牛的饲料转化效率提供了新的思路。

瘤胃菌群肉牛菌群移植 adaptation Beef cattle

蚊子共生功能体

Microbiome: 菌群研究提供控蚊新思路（综述）

Microbiome（IF：8.496）近期发表综述，系统性回顾了蚊子及其共生微生物领域的研究，指出蚊子及其共生菌群构成了典型的共生功能体。共生菌-宿主、共生微生物间的相互作用不仅影响蚊子的生理功能，还会对蚊子传播病毒、寄生虫的能力带来影响，因此菌群操作可能成为控蚊和预防相关传染病的潜在手段。该综述信息全面、内容量大，值得专业人士关注。

蚊子共生功能体菌群互作疾病传播 adaptation Mosquito

抗生素耐药性

TG：非抗生素依赖性的耐药性突变（综述）

① 抗生素使用导致耐药性细菌的选择性积累及传播，然而抗生素耐药性也可能在无抗生素暴露的情况下积累；② 抗生素通常被设计为靶向广泛分布的调节性管家基因；③ 一些研究发现，许多抗生素靶向的调节性管家基因可作为条件适应的中心，与抗生素暴露无关，本综述介绍了相关的最新研究进展；④ 调节性管家基因的某些突变为细菌提供了抗生素耐药性及与抗生素暴露无关的适应性作用。

抗生素耐药性 adaptation antibiotic resistance evolution fitness effects