Reverse ecology

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文章数：2篇

微生物生态学

Cell：PopCOGenT新方法鉴定微生物基因组间的基因流动

2001年人类基因组发布后，进入了后基因组时代，开展人类基因组的多角度挖掘，伴随着一系列的方法和软件的开发，实现了更多研究问题的手段。近年来微生物组研究也积累了大量数据，以人类微生物组计划公布的数据为基础，大家可以将之前很多想法付诸实践。近期Cell就有多篇基于HMP数据挖掘的文章，如本周内同期发表的《Cell：20种宏基因组学物种分类工具大比拼》（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1033790381）、《Cell：挖掘人体菌群中不为人知的小蛋白》（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1056603186）。本文是又一篇基于人类微生物组数据挖掘并开发方法的Cell文章，套路值得学习，软件值得跟进和使用。

微生物生态学 Reverse ecology microbial ecology Population structure population genomics

婴儿肠道菌群

用系统生物学方法，挖掘促进婴儿免疫健康的益生菌/元和食物

怎样筛选能促进婴儿免疫发育的断奶辅食？Microbiome近期发表的一项研究，通过数据挖掘和生物信息学方法，建立了一种研究策略/流程，以找出益生菌-益生元-食物之间的关联，旨在用恰当的辅食来促进婴儿肠道内有益菌的生长，进而优化婴儿断奶期的免疫健康。很有意思的一项研究，有一定转化意义，值得专业人士关注。

婴儿肠道菌群 Infant gut microbiome prebiotic Probiotic Reverse ecology