bile acids

这是发表在Science China Life Sciences的一项工作，由军事医学科学院的杨瑞馥和毕玉晶、南昌大学的徐振江及其团队共同完成。他们通过构建低压性缺氧大鼠模型，对心肌肥厚小鼠的微生物组和代谢组进行研究。结果发现病理性心肌肥厚伴随着拟杆菌属和别样杆菌属的丰度增加，和血浆中丙酸盐的减少。通过粪菌移植可以恢复微生物组结构以及代谢特征，并改善心肌肥厚病症。该工作揭示了肠道菌群及代谢组参与高原心脏病的发生发展机制。

心血管 bile acids cardiac hypertrophy Gut microbiota high altitude

胆汁酸

傅静远等：遗传和菌群与肥胖者的胆汁酸的关系

胆汁酸 bile acids Genetics gut microbiome Liver

结肠炎

膳食果糖调控肠道菌群导致结肠炎恶化

CMGH Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology近期发表的文章，发现高果糖的饮食通过改变肠道菌群及代谢，加剧结肠炎的严重性，突出饮食-菌群互作在肠道炎症中的重要性。

结肠炎 Colitis fructose microbiota bile acids

饮食-菌群互作

不同类型的膳食碳水化合物如何影响人肠道菌群？

饮食中的碳水化合物类型，可能通过改变肠道菌群及其衍生代谢物，来影响心脏代谢风险。American Journal of Clinical Nutrition近期发表的一项临床研究，探索了富含简单、精制或未精制的膳食碳水化合物的饮食，对人肠道菌群组成/功能及特定代谢物的影响。研究表明，吃未精制碳水化合物饮食对肠道菌群和次级胆汁酸有少量影响，可能有助于改善心血管代谢风险因素；简单和精制碳水化合物对肠道菌群的组成和功能也有不同影响。

饮食-菌群互作膳食碳水化合物 carbohydrate quality Microbiome metatranscriptomics

肠易激综合征

Cell：纵向多组学研究挖掘IBS发病机制

肠道微生物组的变化可能参与了肠易激综合征（IBS）的发生发展，但背后的机制仍待深入挖掘。Cell最新发表了来自美国梅奥诊所Purna Kashyap团队与明尼苏达大学Dan Knights团队的研究，通过纵向取样的整合多组学方法，揭示了IBS及其不同亚型（便秘型、腹泻型）的肠道菌群组成和功能（代谢产物、基因）的变化特征，以及这些变化可能参与IBS发病的机制，相关的菌群代谢物和宿主-微生物代谢途径或是潜在的IBS治疗靶点。该研究是通过纵向多组学方法研究人类疾病机制的一个范例。

肠易激综合征 physiology functional bowel disorders Diet symptom severity

粪菌移植

菌群代谢产物在粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染中的作用

粪菌移植（FMT）是治疗复发性艰难梭菌感染（rCDI）的有效手段，但FMT的起效机制尚未明确。Gut Microbes上发表的一篇Addendum，讨论了粪菌移植对肠道菌群代谢产物（包括胆汁酸及短链脂肪酸（SCFA）等）的调节在治疗rCDI中的作用机制，以及粪菌移植对其它菌群代谢产物（包括三甲胺及氧化三甲胺等）潜在影响。

粪菌移植 gut microbiome Metabonomics fecal microbiota transplant Clostridioides difficile infection

几丁质-葡聚糖

几丁质‑葡聚糖与肠道菌群的互作

膳食纤维与肠道菌群的互作在很大程度上促进其生理效应，几丁质-葡聚糖（CG）可改善小鼠的肥胖相关的代谢紊乱，但其对人体肠道微生物群的影响尚未评估。Gut Microbes近期发表的文章，招募15名健康志愿者进行3周的CG补充研究，发现CG的耐受性良好，诱导肠道菌群发生特异性变化，并增加粪便中细菌代谢产物，揭示出几丁质-葡聚糖与肠道菌群之间的相互作用。

几丁质-葡聚糖 Gut microbiota chitin-glucan fiber SCFA

Eubacterium

真杆菌属细菌与人类健康（综述）

在过去的二十年里，我们对肠道菌群及其对健康和疾病的贡献的理解已经发生了转变。在已经被认可的潜在有益微生物的新成员中，有真杆菌属（Eubacterium）的成员，它们构成了人类肠道核心菌群的一部分。发表在Gut Microbes上的一篇综述文章对真杆菌属（Eubacterium），从系统发育的角度概述了真杆菌属细菌的种类，描述了它们如何随着饮食和年龄而改变，并总结了它们与人类肠道和各种健康状况的关系。

Eubacterium 肠道菌群 Gut microbiota short-chain fatty acids Eubacterium hallii

艰难梭菌感染

住院患者感染艰难梭菌，有哪些菌群相关风险因素？

Clinical Infectious Diseases上发表的一项多中心前瞻性队列研究，对1500多名住院患者进行跟踪观察，发现住院期间的产毒艰难梭菌感染的风险因素包括：肺部疾病史、直肠镜检查史及抗生素使用。同时，通过对艰难梭菌感染患者的粪便菌群进行分析，鉴定出了几种可抑制艰难梭菌感染的菌属及菌种，以及艰难梭菌感染患者的菌群功能变化。

艰难梭菌感染 toxigenic C. difficile Gemmiger spp bile acids microbiota

胆盐水解酶

细菌胆盐水解酶的大规模分析及其与人体健康的关系

《Gut Microbes》近期发表的一项研究，利用酶序列和宏基因组数据进行大规模研究，将细菌的胆盐水解酶（BSH）分为7类，并通过肠道菌群宏基因组分析，揭示了不同类型的BSH与人类疾病之间的关联性，提示BSH或能作为一些疾病的无创诊断标志物和潜在治疗靶点。

胆盐水解酶 gut microbiome bile acids Bile salt hydrolase metagenomic cohorts

万古霉素

万古霉素可抑制发酵纤维诱导的小鼠肝癌

膳食纤维被认为对健康有益，但先前的研究表明，在Toll样受体5（TLR5）敲除小鼠中，喂食菊粉可使小鼠的肠道菌群失调，并导致部分小鼠发展出胆汁淤积及肝癌。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现万古霉素可通过改变小鼠的肠道菌群组成，抑制具有纤维发酵及次级胆汁酸生成能力的细菌，以减少次级胆汁酸的产生，从而抑制菊粉等可发酵纤维诱导的肝癌发生。

万古霉素 Toll-like receptor 5 inulin soluble fiber Fermentation

葡萄糖稳态

粪便普雷沃氏菌或能调节葡萄糖稳态

研究以胃切除的非肥胖型糖尿病Goto-Kakizaki大鼠为研究对象，发现其肠道中粪便普雷沃氏菌（Prevotella copri）被显著富集。并且，经过抗生素干预、菌群移植等方法验证了P. copri富集后，小鼠的糖耐受提高。研究认为，P. copri可能是通过胆汁酸代谢和对FXR通路的干预，实现其对血糖的调控。

葡萄糖稳态 16S rDNA bile acids Goto–Kakizaki rat Microbiome

食粪性

食粪性显著影响小鼠上消化道菌群和胆汁酸谱

小鼠肠道菌群研究中非常重要的模式生物，但是小鼠与人体的实际情况仍有不小的差异。Microbiome近期发表一项研究，首次系统地分析了食粪性对小鼠消化道不同部位菌群的组成和功能的影响，发现小鼠小肠的菌群和胆汁酸谱明显受到食粪行为的影响，而非食粪小鼠的情况则与人类更为接近。这些发现提示，研究小肠菌群时，需要注意模式动物食粪性对研究结论的影响。

食粪性小肠菌群 Microbial quantification Metabolomics analyses mouse models

苹果

一天两苹果，改善高胆固醇血症相关指标

American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项最新随机对照交叉试验，在40名健康的轻度高胆固醇血症受试者中发现，相比于摄入苹果汁，每日食用2个富含原花青素的苹果，可显著改善血清胆固醇指标。

苹果 apple Polyphenols flavanols proanthocyanidins

肠道菌群

肠道菌群和昼夜节律在代谢中的交集

Trends in Endocrinology and Metabolism的这篇文章介绍了肠道菌群及其功能产物与生物昼夜节律及宿主代谢间的紧密关系。现已有不少研究鉴定出参与菌群-生物节律（CRs）网络中的代谢物，它们有的源于宿主，有的源于肠道菌群，然而我们至今仍对这个庞大网络的作用机制不甚了解。对未来想通过菌群-CRs网络调节宿主代谢的研究者，作者提出关注样本选择（如减少对粪样依赖）、校准取样时间、人样和动物模型间区别、外界环境和性别等对研究结论影响的建议。

肠道菌群昼夜节律代谢短链脂肪酸（SCFA）胆汁酸

菌群-免疫互作

Cell：服用抗生素期间接种疫苗，可能削弱疫苗效果

在动物模型中，用抗生素减少肠道菌群，可对免疫功能产生影响，但人体中的相关研究还比较匮乏。Cell最新发表来自斯坦福大学医学院的研究，表明在健康人中，服用抗生素引起的肠道菌群变化，会削弱流感疫苗在人体中的免疫效果，并分析了其中的生物学机制，菌群扰动引起的次级胆汁酸减少和脂肪酸代谢物改变可能有主要作用。

菌群-免疫互作 influenza microbiota vaccines systems vaccinology

瘦型非酒精性脂肪性肝病

瘦型脂肪肝患者有独特的胆汁酸和肠道菌群特征

约25%的成年人患有非酒精性脂肪性肝病（NAFLD），其中有相当比例的人并不胖，这类患者的发病机理尚不清楚。Hepatology近期发表的一项研究，鉴定出瘦型NAFLD患者独特的胆汁酸谱和肠道菌群特征，并在用高胆固醇饲料喂养的瘦NAFLD小鼠模型中确认了这些特征，表明抑制胆汁酸重吸收或许是改善瘦型NAFLD的治疗策略。

瘦型非酒精性脂肪性肝病 NAFLD Fibrosis lean bile acids

粪菌移植

粪菌移植治疗肥胖效果如何？

动物研究显示，肠道菌群可影响肥胖发生，用粪菌移植（FMT）治疗肥胖是菌群转化应用领域的热点问题。《Clinical Gastroenterology and Hepatology》近期发表的一项初步临床试验，首次报道了在无代谢障碍的肥胖患者中进行FMT的短期效果和安全性。尽管FMT有效而持续的改变了受试者的肠道菌群组成和胆汁酸代谢，使之变得更像瘦供体，但短期内的BMI没有显著变化。FMT能否治疗肥胖？目前看来，仍需更多扎实的临床和机制性研究。

粪菌移植 overweight Treatment bacteria microbe

肠道屏障

高脂饮食如何破坏肠道屏障（综述）

《Advances in Nutrition》近期发表综述，详述了过量膳食脂肪对肠道屏障的破坏作用及其生物学机制，对理解与肠道屏障失调相关的疾病（如炎症性肠病等）以及膳食成分与肠道菌群和宿主的互作，很有参考意义。

肠道屏障 bile acids Gut barrier Gut microbiota high-fat diet

定植抗性

菌群定植抗性与肠道感染（综述）

肠道菌群的定植抗性影响肠道致病细菌感染。《Microbiology and Molecular Biology Reviews》近期发表综述，系统性总结了肠道菌群形成定植抗性的模式以及致病菌克服定植抗性的机制，对于了解定植抗性与肠道细菌感染具有重要参考价值。

定植抗性肠道感染 bacterial enteric infection Bacteriocins bile acids

IBD

IBD患者肠道菌群的次级胆汁酸代谢能力

IBD gut microbiome bile acids Host-microbe interactions Metabolism

肝脏代谢

肠道菌群及胆汁酸代谢影响宿主糖代谢

《Hepatology》近期发表研究，发现阻断肠道的脂质运输可能改善糖代谢状况，该过程可能与菌群变化、胆汁酸代谢变化相关，尤其可能与Akk细菌的富集有关，对于阐释肠道菌群及其代谢对宿主的影响具有参考价值。

肝脏代谢 chylomicrons abetalipoproteinemia Akkermansia bile acids

原发性胆汁性胆管炎

原发性胆汁性胆管炎的首篇多组学研究

这是一篇关于原发性胆汁性胆管炎（PBC）的多组学研究。本研究基于胆酸分泌异常的PBC患者肠道菌群失调，而接受熊去胆酸(UDCA）治疗后可稍微恢复为研究背景，进行大样本量的横向和长期的纵向对比研究，分析未接受治疗患者、健康人群和接受治疗后患者的血清和粪样胆汁酸成分，以及粪样中的菌群成分，最后进行关联性分析。作者最后提到本研究虽然得到菌群成分变化与血清和粪样中胆汁酸变化相关，但仍不具有因果关系，以及本实验未考虑饮食因素。

原发性胆汁性胆管炎胆汁酸肠道菌群 bile acids Gut microbiota

益生菌

布拉氏酵母菌或可通过调节胆酸抑制艰难梭菌感染

《Frontiers in Microbiology》近期发表研究，发现布拉氏酵母菌对艰难梭菌感染的抑制作用，可能与抑制肠道中胆酸产生水平有关。该结果对阐释布拉氏酵母菌的益生菌机制具有参考价值。

益生菌艰难梭菌感染 Saccharomyces boulardii antibiotics bile acids

胆盐水解酶

中国药科大学：全方位揭示人类肠道菌群中的细菌胆盐水解酶

胆盐水解酶（BSH）在胆汁酸代谢中有重要作用，存在于多种肠道细菌中。Microbiome近期发表了来自中国药科大学团队的研究，主要通过生物信息学方法，对人类肠道菌群中的BSH蛋白序列进行全方面分析，包括其在不同肠道菌中的分布、在不同人群中的分布和活性差异，并对BSH进行类型划分和活性比较，还分析了BSH丰度与代谢疾病的关联，对未来研究菌群胆汁酸代谢和相关疾病，有重要参考意义。

胆盐水解酶人体肠道菌群 Bile salt hydrolase (BSH) Gut microbiota Taxonomic identification

粪菌移植(FMT)

粪菌移植改善患者的菌群结构与代谢谱

粪菌移植可有效治疗艰难梭菌感染。本研究阐释了粪菌移植对患者粪便菌群、胆汁酸组成变化以及脂肪酸成分的影响，尤其强调了患者在接受粪菌移植前后脂肪酸变化不显著，而且可能与饮食有关，值得相关专业人士参考。

粪菌移植(FMT) Archaea bile acids Clostridioides difficile Faecal microbiota transplantation

甲硫氨酸限制

Cell子刊：少吃甲硫氨酸延长早衰小鼠寿命

甲硫氨酸限制 aging dietary intervention Caloric restriction methionine restriction

胆汁酸

肠道菌群参与多氯联苯与胆汁酸稳态间的互作

Toxicological Sciences近期发表来自华盛顿大学华人学者Julia Yue Cui主导的研究，污染物多氯联苯的口服暴露，可影响小鼠肠道菌群组成和功能，并影响宿主胆汁酸代谢稳态。

胆汁酸 PCBs Gut microbiota bile acids Liver

肥胖与饮食

脂肪酸类型影响肥胖

明确的饮食-菌群互作关系有利于研究菌群对宿主的影响。本研究以雄性C57BL / 6N的SPF/无菌小鼠为模型，研究膳食脂肪对肥胖表型影响与肠道菌群的关系，发现胆汁酸配合不同类型的脂肪，很可能通过影响肠道菌群改变宿主的代谢状态，对于研究饮食干预、菌群代谢等都具有参考价值，值得专业人士关注。

肥胖与饮食膳食脂肪代谢疾病 16S rRNA gene amplicon sequencing bile acids

胆汁酸

肠道菌群对氢气与胆汁酸的代谢作用（综述）

胆汁酸氢气放线菌门 acetogenesis bile acids