毒力因子

结直肠癌（CRC）是全球第三大常见恶性肿瘤。在中国，结直肠癌的发病率和死亡率一直在上升，这可能是由于经济发展、生活方式和饮食变化所致。近日，中国人民解放军总医院杨云生及团队在Gut Microbes发表最新综述，总结了中国目前关于肠道菌群在结直肠癌中作用的证据，主要包括肠道菌群特征，特别是具核梭杆菌和微小微单胞菌，已被确定在结直肠癌患者中富集。此外，本文还讨论了肠道菌群在放化疗和免疫治疗中的作用，以及具有中国特色的肠道微生物群干预措施的应用，包括微生态药物、粪便微生物群移植和中药，值得关注。

结直肠癌肠道菌群综述基础研究毒力因子

猕猴

四川大学：在猴肠道中发现大量微生物新基因组

基于宏基因组组装普通猕猴肠道微生物基因组对于理解其作为重要的非人灵长类模式动物具有重要意义。近日，四川大学的张安云、李静及团队在Gut Microbes发表最新研究，通过对猕猴粪便宏基因组数据进行基因组组装，进一步扩大了其肠道微生物基因组的多样性。此外，发现猕猴肠道中弯曲菌属和螺旋杆菌科的MAGs主要携带鞭毛和趋化性相关的毒力基因，可能在猕猴腹泻过程中发挥潜在作用。总之，该研究为预防恒河猴腹泻提供了新的见解，值得关注。

猕猴宏基因组组装基因组 (MAGs) 研究论文基础研究 CAZymes

具核梭杆菌

中山大学：具核梭杆菌的毒力因子可促进结直肠癌转移

具核梭杆菌（Fn）是一种关键的结直肠癌相关细菌。DNA饥饿/稳定期保护蛋白（Dps）是一种细菌铁蛋白，可在氧化应激中保护细菌DNA。中山大学的张革团队与刘万里团队在PLoS Pathogens上发表的一项最新研究结果，鉴定出Fn在饥饿条件下产生的一种新型毒力因子——Fn-Dps，后者可通过竞争铁来源，从而损伤红细胞，并通过诱导巨噬细胞表达趋化因子CCL2/CCL7，从而促进结直肠癌转移。在结直肠癌患者中，可检测到高水平的Fn-Dps抗体。

具核梭杆菌毒力因子研究论文基础研究结直肠癌

大肠杆菌

南开大学Science子刊：揭秘致病性大肠杆菌毒力基因的表达调控

大肠杆菌是正常肠道微生物组的一部分，但一些肠出血性大肠杆菌（EHEC）和肠致病性大肠杆菌（EPEC）菌株可能导致危及生命的胃肠炎。肠出血性大肠杆菌和大肠杆菌致病能力的毒力因素包括肠上皮细胞消失（LEE）致病岛基因座中编码的基因。来自南开大学的刘斌团队在Science Signaling发表文章，发现在富含磷酸盐的条件下，大肠杆菌中的小RNA EsrL刺激肠出血性大肠杆菌和大肠杆菌中毒力基因的表达，从而在富含营养的肠道环境中促进肠出血性肠出血性肠道杆菌和大肠菌群的致病性。

大肠杆菌致病菌小RNA 磷酸盐毒力因子

毒力因子

屎肠球菌SF68通过精氨酸脱亚胺酶抑制先天性免疫应答

在动物实验及临床试验中，屎肠球菌SF68可缓解肠道炎症。Gut Microbes上发表的一项最新研究结果，发现屎肠球菌SF68可通过产生精氨酸脱亚胺酶，抑制肠道上皮细胞的NF-κB及JNK信号通路活化。

毒力因子屎肠球菌SF68 精氨酸脱亚胺酶研究论文基础研究

艰难梭菌感染

西湖大学Cell突破：超毒力艰难梭菌毒素如何伤肠道？锁定关键受体

艰难梭菌引起的肠道感染可导致腹泻甚至严重的结肠炎，TcdB是艰难梭菌引发肠道疾病的主要毒力因子，有多个亚型，其中TcdB1/3/5以FZD为肠上皮受体，而对于致病性强的超毒力分支菌株表达的TcdB2/4，其肠上皮受体尚不明确。Cell最新发表来自西湖大学陶亮、李颜颜与团队的研究成果，鉴定出组织因子途径抑制物（TFPI，一种可存在于细胞表面的抗凝血蛋白）是TcdB2/4的受体，对TFPI-TcdB4互作进行了结构分析，在小鼠模型中揭示了TFPI的病生理意义，并表明其阻断剂可保护小鼠抵抗艰难梭菌TcdB对肠上皮的损伤。这些发现揭示了艰难梭菌感染的新的致病机理，为其治疗提供了新方法。

艰难梭菌感染毒力因子肠隐窝致病机制

穿山甲

于黎+张志刚+陈武：肠道菌群研究助力穿山甲圈养保护

云南大学于黎、张志刚和广州动物园及广州市野生动物研究中心陈武与研究团队近期在Journal of Genetics and Genomics发表研究，比较了穿山甲在人工圈养和野生环境下的肠道菌群组成与功能变化。该研究结合16S rRNA基因扩增子测序和宏基因组数据，比较了人工圈养与罚没救助的野生马来穿山甲、中华穿山甲肠道菌群的组成和功能，并探讨不同圈养时间以及救助过程中使用抗生素治疗与否对穿山甲肠道微生物的影响。该研究为优化圈养救治穿山甲的饮食结构、选择使用抗生素，探讨潜在的患病机制提供了重要理论依据，对该类群的保护具有重要指导意义。

穿山甲肠道菌群 16S rRNA扩增子测序宏基因组抗性基因

宏基因组学

使用PathoFact鉴定宏基因组中毒力因子和耐药基因

PathoFact是一个能够高度准确地（分别为0.921、0.832和0.979）和特异性（0.957、0.989和0.994）对毒力因子、细菌毒素和耐药基因进行预测的工具。该工具结合了这些致病因子的预测和可移动遗传元件的识别。通过考虑相关基因的基因组背景，这为分析提供了进一步的深度。此外，PathoFact的毒力因子，毒素和抗菌素耐药基因模块可以独立应用，从而使其成为一个灵活而通用的工具。在预测毒力因子和毒素基因方面，PathoFact优于所有现有的工作流程。在预测抗菌素耐药性方面，它的性能可与一套流程相媲美，而优于其他。PathoFact及其模型和数据库可在https://pathofact.lcsb.uni.lu上免费获得。

宏基因组学毒力因子耐药基因可移动遗传元件模块化

自闭症谱系障碍

王明帮等：肠道IgA+菌群毒力因子基因，助力自闭症早期诊断

前期研究发现，自闭症谱系障碍（ASD）患儿的肠道IgA水平显著升高，且肠道菌群发生改变。复旦大学附属儿科医院王明帮、周文浩和德宏州人民医院Zhaoqing Yin与团队，在Computational and Structural Biotechnology Journal上发表的一项最新研究，发现ASD患儿与正常儿童的毒力因子相关肠道菌群（VFGM）基因的组成及多样性有显著差异，结合VFGM基因多样性、肠道IgA水平及特定VFGM基因的丰度开发机器学习算法，可准确区分ASD患儿及正常儿童。

自闭症谱系障碍机器学习毒力因子 IgA 研究论文

金黄色葡萄球菌

Science子刊：金黄色葡萄球菌的Agr系统促进特应性皮炎的发展

特应性皮炎（AD）与金黄色葡萄球菌在感染皮肤处的定殖相关。Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，发现婴儿6月龄时的金黄色葡萄球菌皮肤定殖与AD风险增加相关，但1月龄时的金黄色葡萄球菌定殖发生在近半数婴儿中，且与AD无显著关联。通过全基因组测序，对比分析AD婴儿及非AD婴儿皮肤中的金黄色葡萄球菌分离株后发现，非AD婴儿中的金黄色葡萄球菌的Agr群体感应系统发生了功能性突变。在小鼠中，Agr系统的正常功能对于金黄色葡萄球菌的表皮定殖及诱导AD样炎症是必需的。

金黄色葡萄球菌特应性皮炎全基因组测序群体感应系统毒力因子

噬菌体疗法

噬菌体治疗肠道细菌感染的新思路

mSystems发表的一项研究，使用一种温和的噬菌体（一种能将自身基因组整合到细菌基因组中的噬菌体），通过在遗传水平上修改细菌的功能，来抑制毒性因子的表达。结果表明，单剂量的工程噬菌体可以在细菌中繁殖，并在肠道感染小鼠模型中减少志贺毒素的产生，且不会显著影响细菌浓度。本研究或提供了一种治疗肠道细菌感染的新思路。

噬菌体疗法 Shiga toxin antivirulence Bacteriophage Microbiome

大熊猫

大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析

目前关于大熊猫源大肠杆菌的研究主要集中在对大熊猫肠道内大肠杆菌的分离鉴定、耐药性检测等，但有关大熊猫肠外大肠杆菌相关的研究报道还较少。本研究通过全基因组测序技术首次对泌尿生殖道感染出现潜在出血的大熊猫尿液中分离的大肠杆菌CCHTP进行检测，主要研究了其中毒力因子及耐药基因情况，可较为全面地预测大肠杆菌中耐药基因、耐药谱、毒力因子及相关毒力基因等重要致病特性。研究结果可为圈养大熊猫临床治疗和合理用药提供指导，为后续开展圈养大熊猫源病原菌中毒力因子和耐药基因研究提供依据。

大熊猫大肠杆菌全基因组测序耐药基因毒力因子

细菌感染

弗氏志贺菌抑制宿主细胞的胞内运输以促进其感染

细菌感染 bacteria endocytosis Pathogen polarity

肠道致病菌

关于肠道沙门氏菌的一些事实（综述）

肠道沙门氏菌（Salmonella enterica）在分类学上属于细菌界、变形菌门、γ变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科、沙门氏菌属，为革兰氏阴性肠道杆菌，是引起急性胃肠炎的主要病原菌，可通过食物或接触传播。沙门氏菌病是公共卫生学上具有重要意义的人畜共患病之一。发表在《Trends in Microbiology》上的一篇综述文章对S.enterica致病的分子基础及其相关疾病特征进行了概括性的描述，供相关人士参考。

肠道致病菌 enteric fever foodborne gastroenteritis Pathogenesis

环境菌群

国际空间站中的环境菌群及耐药基因

《Microbiome》上发表的一项研究，对国际空间站中的环境菌群进行了宏基因组分析，可检测到多种致病菌、耐药基因及毒力因子。该结果有助于阐释环境菌群的形成的发展，有助于优化空间站等密闭空间环境的方法。

环境菌群 built environment functional metagenomics International Space Station metagenome

长双歧杆菌婴儿亚种EVC001

特定益生菌或能帮母乳喂养婴儿减少肠道菌群的“坏分子”

一项I期临床试验（doi.org/10.1186/s12887-017-0886-9）的后续研究，用鸟枪法宏基因组学技术，分析了给母乳喂养婴儿短期补充长双歧杆菌婴儿亚种EVC001，对肠道菌群中的潜在致病菌和毒力因子基因丰度的影响。

长双歧杆菌婴儿亚种EVC001 毒力因子婴儿母乳喂养 Wan-Yu Lin

毒力因子

Nature Reviews：不杀病菌，专除毒力分子的创新疗法（综述）

这是系统性介绍抗毒力疗法的重量级综述，非常值得认真读一读。在抗生素耐药性越来越严重的当下，不给病原菌选择压力，让它们存活，但把它们分泌出来的毒力分子给干掉，很是巧妙，对吧？严重推荐阅读本文。

毒力因子水平转移耐药性抗毒力疗法