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抗性基因
文章数:8篇
穿山甲
于黎+张志刚+陈武:肠道菌群研究助力穿山甲圈养保护
云南大学于黎、张志刚和广州动物园及广州市野生动物研究中心陈武与研究团队近期在Journal of Genetics and Genomics发表研究,比较了穿山甲在人工圈养和野生环境下的肠道菌群组成与功能变化。该研究结合16S rRNA基因扩增子测序和宏基因组数据,比较了人工圈养与罚没救助的野生马来穿山甲、中华穿山甲肠道菌群的组成和功能,并探讨不同圈养时间以及救助过程中使用抗生素治疗与否对穿山甲肠道微生物的影响。该研究为优化圈养救治穿山甲的饮食结构、选择使用抗生素,探讨潜在的患病机制提供了重要理论依据,对该类群的保护具有重要指导意义。
穿山甲
肠道菌群
16S rRNA扩增子测序
宏基因组
抗性基因
纳米孔测序技术
NanoARG:一个用于检测纳米孔测序宏基因组数据中细菌耐药基因的在线平台
NanoARG中的Nano代表着这是一款专门为纳米孔测序结果开发或优化的抗性基因分析软件。
纳米孔测序技术
antibiotic resistance
metagenomics
Metal resistance
Mobile genetic elements
抗性基因
纳米颗粒降低菌群中抗性基因的多样性和丰度
纳米科技真神奇!华东师范大学Xie Bing发现,纳米颗粒不仅可以杀菌,还能特异性的降低菌群中抗性基因的多样性和丰度。
抗性基因
纳米颗粒
Antibiotic resistance genes
Bacterial proliferation
Ion dissolution
抗性基因
Nature Reviews:细菌耐药性的研究方法(综述)
作者系统阐述了基于测序的抗性基因发现、抗性基因数据库的建设、功能宏基因组学在抗性基因研究中的应用和通过机器学习预测抗性基因的方法,非常值得相关研究人员关注。
抗性基因
宏基因组
功能宏基因组
机器学习
基因组数据库
抗性基因
Nature子刊:环境中的抗性基因主要来源于粪便污染
污水处理并不能完全消除其中的抗性基因,处理后的净水排放到环境中仍然可能会导致抗性基因的扩散。为了区分净水排放和环境选择等因素对于抗性基因富集的贡献,作者巧妙的选用了人粪便标记物crAssphage,对现有的宏基因组进行数据挖掘,最终明确了环境中抗性基因主要是粪源输入的结论。
抗性基因
数据科学
宏基因组
Harry J Flint
Shui Ping Wang
抗性基因
Nature子刊:无需担心肠道菌群耐药基因转移到病原菌中
鉴于肠道菌群中含有丰富的抗生素耐药基因,故一般认为存在抗性基因转移到人致病菌中的风险。Nature Microbiology上的一篇长文通过蛋白质结构预测和抗性蛋白生物活性验证等方法证实,这种担心恐怕是多余的。
抗性基因
肠道宏基因组
蛋白结构
合成生物学
病原菌
抗性基因
宏基因组方法分析空气中的抗性基因
本研究发现,养殖场和污水处理厂的气溶胶中存在大量抗性基因,说明这些耐药基因池中的抗性基因或可释放到空气中传播。
抗性基因
宏基因组
婴儿肠道菌群
STM:抗生素,到底对婴儿肠道菌群有何影响?
39个孩子,3年持续不断的收集样本并分析肠道菌群,发现了什么规律?有什么巨大参考意义?请看文献。
婴儿肠道菌群
抗生素
抗性基因
拟杆菌
剖腹产