病原菌

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文章数：11篇

Nature子刊：抗生素对人类肠道微生物组耐药性的影响

抗生素的广泛使用推动了病原微生物耐药性的进化，既增加了微生物耐药性基因（ARGs）的流行率，又通过水平基因转移在物种间传播。然而，ARGs对于人体相关的更广泛的共生微生物群落的影响还不太清楚。近日，韩国中央大学研究人员在Nature Communications发表最新研究，通过人体不同部位微生物组宏基因组样本，评估ARGs在种群水平上的影响，发现ARGs的新颖性、种类及多样性和人体采样点、国家、抗生素使用有关，还发现人体肠道ARGs可能存在两种不同的抗性型，值得关注。

抗生素耐药基因研究论文基础研究宏基因组组装基因组 (MAG)

Nature子刊：首次证实耐药菌肠肺易位增加感染风险

细菌可以定植于人体不同的位置，且可能发生易位。但是这种细菌易位的致病机制和对病原菌宿主适应性的影响仍不清楚。尽管有研究显示，在危重病人中，肠肺的菌群易位与患者临床感染有显著相关性。但是针对单个病原菌的肠肺易位动态变化，以及其肠肺易位结果和病原菌的耐药性的影响尚不清楚。近期一篇发表在Nature子刊Nature Communications上的研究工作，针对临床一例ICU危重病人进行了为期30天的监测，联合基因组学、表型分离、宿主免疫分析和临床数据结合的研究方法，揭示了机会致病菌绿脓杆菌的肠肺转移是导致感染的重要因素，但是易位对于病原菌耐药性的产生影响不大。这些结果提示，降低绿脓杆菌在肠道的定植是有效避免危重患者发生绿脓杆菌感染的有效方案。

病原菌肠肺易位危重病人绿脓杆菌感染耐药性

国内团队：暴露于氟化物或可引起小鼠肥胖，潜在机制是何？

适当剂量的氟可以预防龋齿并有利于骨骼的发育。然而，过量摄入氟化物会导致氟斑牙、氟骨症、氧化应激和神经毒性等疾病。多项研究报道氟诱导会引起肥胖，但潜在机制仍不清楚。近日，南京农业大学曾晓雄、湖南农业大学刘仲华及团队在Journal of Advanced Research发表最新研究，发现高浓度氟暴露会显著加剧高脂饮食喂养小鼠的肥胖，进一步研究发现可能和肠道屏障受损以及病原菌Erysipelatoclostridium ramosum增殖有关，而通过茯砖茶多糖靶向肠道菌群或可预防氟诱导引起的肥胖。总之，该研究为防控氟摄入诱导的肥胖提供了新见解，值得关注。

氟化物肥胖研究论文基础研究高脂饮食

病原菌效应因子与宿主吞噬蛋白互作，决定宿主先天免疫反应

宿主免疫细胞通过其模式识别受体（PRR）特异性识别细菌的病原体相关分子模式（PAMP），从而启动机体的防御系统。脂多糖作为革兰氏阴性菌细胞壁的主要成分，是受宿主免疫识别的重要PAMP之一。然而，不仅仅病原菌细胞壁存在LPS，而且肠道正常共生革兰氏阴性菌也具有LPS分子，然而宿主对于这两种细菌的免疫反应有显著的差异。宿主如何区分病原菌和共生菌而产生不同的免疫反应的机制尚不明确。近期一篇发表在Gut Microbes的研究，通过分析发现在不同物种的病原菌与共生菌相比，病原菌具有一种含有WxxxE特征序列的效应因子。进而用沙门氏菌为模式，研究发现WxxxE特征序列对于SifA效应因子与宿主吞噬蛋白ELMO1相互作用非常的关键，而SifA-ELMO1互作对于细菌在宿主中的定植、传播和炎症反应具有重要的作用。

病原菌 WxxxE家族效应蛋白 ELMO1 SifA 炎症水平

根系分泌物

植物次生代谢物与菌群互作研究进展

近年来，随着植物代谢组学与微生物组学研究的深入，植物次生代谢物被发现作为植物和微生物共生的信号修饰与宿主相关的菌群。另外，许多研究表明植物微生物(组)亦可直接或间接地通过调节植物次生代谢参与上述生理过程。该综述聚焦植物次生代谢产物与菌群互作，以香豆素等重要植物次生代谢物为例，系统回顾了近年来该领域的最新进展，并对目前主要的微生物组学和代谢组学关联分析技术与工具方法进行了梳理，对植物次生代谢产物与微生物组互作研究在作物遗传育种、非生物胁迫、入侵植物等领域的发展及应用进行了讨论和展望。

根系分泌物多组学植物激素挥发性物质VOCs 根瘤菌

噬菌体疗法

Cell 子刊：宏基因组数据分析，如何助力噬菌体疗法？

噬菌体疗法是消除肠道有害细菌的高度特异性治疗方法。然而，噬菌体和肠道细菌之间的感染关系尚未完全阐明。Cell Host and Microbe发表的一篇文章，对101个健康日本人的肠道病毒组和细菌组进行了宏基因组分析，鉴定出能特异性控制病原微生物的噬菌体来源抗菌酶。利用抗菌酶干预艰难梭菌感染的小鼠，可以显著提高小鼠的成活率。本研究结果表明，基于宏基因组分析的宿主细菌-噬菌体关联信息，有利于改造噬菌体以消灭病原菌，并为开发各种与肠道菌群失调相关疾病的治疗方法提供借鉴。

噬菌体疗法宏基因组 Bacteriophage metagenome analysis Virome

Nature子刊：无需担心肠道菌群耐药基因转移到病原菌中

鉴于肠道菌群中含有丰富的抗生素耐药基因，故一般认为存在抗性基因转移到人致病菌中的风险。Nature Microbiology上的一篇长文通过蛋白质结构预测和抗性蛋白生物活性验证等方法证实，这种担心恐怕是多余的。

抗性基因肠道宏基因组蛋白结构合成生物学病原菌

短读长测序

AEM：短读长测序用于食品污染安全监测，大有可为！

这篇研究很有意义，发现利用短读长测序方法，有效监测到被奶牛肠道菌群污染的发酵乳制品，其快速、高效、成本低廉，或可称为食品安全利器！值得关注！

短读长测序宏基因组发酵乳制品饮料食品安全病原菌

重磅综述：对抗病原菌，肠粘膜免疫力怎样给力？

① 宿主防御机制诱导和类型、应答程度和病程长短因致病菌的不同而不同；② 致病菌利用肠道菌群在肠道中定植，同时也被肠道菌群维持的肠道固有免疫微环境抑制；③ TLR激活能够抑制沙门氏菌感染但对于柠檬酸杆菌等非侵入性致病菌定植有利，而NOD样受体激活可控制后者；④ 受体的激活引起宿主促炎症因子表达，IL-17、IL-22在多种致病菌感染时高表达；⑤ 本文解析肠道菌群对致病菌免疫反应影响，详细介绍应对致病菌的先天免疫和适应性免疫机制。

肠道菌群病原菌免疫粘膜免疫

Cell：靶向肠道菌群的疗法，有挑战但更可为！

去年年底Cell上发表的一篇综述，昨天Cell又再次在当期目录中列示并推荐阅读，这确实是一篇短小但值得深读的综述，推荐给大家。

病原体病原菌菌群靶向调节艰难梭菌肠道传染病

Nature免疫学：肠道菌群如何控制病原体？必读

13年的综述，值得一看。

肠道菌群免疫病原菌