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基因组数据库
文章数:4篇
抗性基因
Nature Reviews:细菌耐药性的研究方法(综述)
作者系统阐述了基于测序的抗性基因发现、抗性基因数据库的建设、功能宏基因组学在抗性基因研究中的应用和通过机器学习预测抗性基因的方法,非常值得相关研究人员关注。
抗性基因
宏基因组
功能宏基因组
机器学习
基因组数据库
基因组数据库
Nature子刊:仅用万分之一空间便可存储所有细菌和病毒的基因组信息
生物大数据的产生给我们带来了存储、检索等方面的挑战。Nature Biotechnology上介绍的一种新型基因组存储、检索方案,仅用比传统方法低四个数量级的空间就可存储目前所有的约44万个细菌、病毒基因组信息,并可有效用于基因检索,值得参考。
基因组数据库
生物信息学
生物信息学算法
Maria Antfolk
Kim B Jensen
基因组数据库
Nature子刊:包含近800个肠道菌株全基因组数据的新数据集
Nature Biotechnology上发表的一项最新研究,发布了一个新的人体肠道细菌基因组数据集,包含了来自4个门、31个科、273个种的737个菌株的全基因组数据,这些菌株是从20个成年人的粪便样本中培养并分离的。该数据集使人体胃肠道细菌基因组的数量增加了37%。
基因组数据库
人粪便菌群
宏基因组
培养组学
基础研究
生物信息学
IMG/M 5.0:下一代的基因组数据库
说起基因序列数据库“三巨头”,大多数研究人员都耳熟能详,它们分别是GenBank/EBI/DDBJ。这些数据库在设计之初考虑了存储的需求,而在分析和数据挖掘上的功能设计则比较欠缺。IMG/M 作为新一代基因组数据库的代表,不仅完整收录现有数据库的内容,还提供了更完善的注释和丰富的分析工具。
生物信息学
生物信息学工具
基因组数据库
IMG/M
宏基因组