functional metagenomics

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文章数：3篇

菌群-宿主互作

功能基因组学结合微流控，高效挖掘微生态功能基因

高效的功能基因组方法，有助于阐释肠道微生物利用肠粘膜多糖的机制。本研究建立了一种高效的微生态功能基因组研究方法，通过建立长片段fosmid文库、微液滴筛选大肠杆菌表达株，可利用常规流式细胞分选仪进行高通量功能基因组筛选，适用于各种基于宏基因组的功能筛选。利用该方法，本研究鉴定了细菌中与IBD相关的粘蛋白聚糖分解酶，有望从菌种特异的功能基因角度阐释IBD患者肠道菌群特点。

菌群-宿主互作 functional metagenomics Droplet microfluidics Human gut microbiota Human glycans

Cas9抑制蛋白

Cell子刊：鉴别分布广泛的CRISPR/Cas9抑制蛋白

噬菌体会产生抵抗蛋白来抵御细菌、古菌的CRISPR/Cas9免疫系统。《Cell Host and Microbe》近期发表研究，介绍了一种可根据蛋白功能来筛选CRISPR/Cas9抵抗蛋白的方法，用该方法发现抑制Cas9的蛋白家族广泛分布于土壤、动物和人体菌群中，对应的基因存在横向转移的可能。

Cas9抑制蛋白 CRISPR/Cas系统 CRISPR Cas9 inhibitor anti-CRISPR

国际空间站中的环境菌群及耐药基因

《Microbiome》上发表的一项研究，对国际空间站中的环境菌群进行了宏基因组分析，可检测到多种致病菌、耐药基因及毒力因子。该结果有助于阐释环境菌群的形成的发展，有助于优化空间站等密闭空间环境的方法。

环境菌群 built environment functional metagenomics International Space Station metagenome