宿主表型关联

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宿主表型关联

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Nature子刊：健康人血液中不存在“核心”菌群

传统观点认为血液应该是无菌环境，而病原体一旦进入血液，会增殖引发宿主反应失调，导致败血症及感染性休克等临床症状。先前一项研究发现大多数癌症的组织和血液中具有共性微生物的DNA特征，但仍存在诸多问题等待解答。近日，新加坡基因组研究所研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，基于对9770个健康人的血液测序，发现健康人血液内不存在相似的微生物群落，且微生物的种类与健康人的表型无明显关联。此外，82%的健康人血液样本中并未检测到微生物。这也间接说明癌症病人血液的微生物可能是由于在疾病状态下黏膜和上皮屏障的完整性受到损害导致微生物能够进入血液，从而引起血液微生物谱的改变，提示我们基于血液微生物的疾病诊断需要基于病理组织的微生物谱变化，值得关注。

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宿主表型关联

华中师范大学：评估微生物组多类表型最佳的关联工具—multiMiAT

随着生物信息学的快速发展，基于微生物组的关联测试工具已被广泛开发，以检测微生物组和宿主表型之间的关联。然而，现有的方法在检测微生物组与多分类表型（如疾病严重程度和肿瘤亚型）间的关联方面仍没有展示出令人满意的性能。近日，华中师范大学蒋兴鹏及团队在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，开发了一种用于评估微生物组多类表型最佳的关联工具multiMiAT（https://github.com/xpjiang-ccnu/multiMiAT），在模拟和真实数据中性能较好，值得测试。

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