李俊桦
深圳华大生命科学研究院欧洲分院执行院长、深圳华大生命科学研究院研究员
李俊桦,博士,研究员,主要从事微生物组学、病原组学及相关生物信息分析技术研究。已发表高水平SCI文章60余篇,Google Scholar H-index 38,其中以第一作者/通讯作者在Nature Biotechnology,Cell Host &Microbe,Nature Communications,Nature Aging等国际高水平学术期刊发表论文35篇,共被SCIE收录论文引用2041次,其中他引1835次,4篇论文入选ESI高被引论文,单篇论文最高引用921次,入选科睿唯安(Clarivate)2019年度和2020年度全球“高被引科学家”。申请受理发明专利13项(其中PCT专利9项),获授权发明专利8项、实用新型专利1项,授权软件著作权11项。中国国家标准GB/T 40226-2021主要起草人。ISO/TC276/WG3&WG4工作组专家成员。学术期刊Microbiology Spectrum编委,学术期刊Frontiers in Medicine、Frontiers in Public Health副编辑(Associate Editor)。科技部、国自然基金委、广东省科技厅基金项目和人才项目评审专家库成员。Cell Host & Microbe、Nature Aging、Emerging Microbes & Infections、 Genome Medicine等多个国际学术期刊审稿专家。
王卫庆/毕宇芳/钟焕姿/李俊桦Nature子刊:更年轻化的肠菌或可降低代谢不健康相关心血管病风险
瑞金医院王卫庆、毕宇芳和华大基因钟焕姿、李俊桦作为共同通讯作者发表研究,揭示与年龄和代谢相关的肠道微生物组特征如何影响心血管疾病风险。
06-12
施莽/李俊桦等Nature子刊:全国范围内蚊虫病毒组有何特征?
中山大学施莽和吴未辰、华大研究院李俊桦和王达希、复旦大学李博及团队发表研究,探究多种蚊虫在不同生境下病毒的多样性、传播分布的影响因素及地理谱系特征。
03-28
纪立农+李俊桦+钟焕姿等:降糖药与糖尿病肠道菌群间的双向互作
北京大学糖尿病中心纪立农、深圳华大生命科学研究院李俊桦和钟焕姿、首都医科大学李玉凤作为共同通讯作者,近期在Diabetologia发表了一项随机非盲双臂试验的研究结果,揭示了两种口服降糖药——阿卡波糖和维达列汀治疗对糖尿病患者肠道菌群的影响,包括一些共性的菌群反应。该研究进一步分析了基线肠道菌群与药物的肠道相关疗效(GLP-1分泌)的关联,或有助于糖尿病精准治疗的患者分层。
2022-08-12
李俊桦+肖敏凤Cell子刊:一文读懂人类肠道病毒组编目的进展和挑战(综述)
随着相关人类肠道病毒组数据库的建立,不仅丰富了肠道病毒基因组的多样性和功能潜力,也为相关肠道病毒组研究提供了参考数据库。近日,深圳华大生命科学研究院李俊桦、肖敏凤及团队在Cell Host and Microbe发表综述,总结了最近发表的4个人类肠道病毒组数据库,并对未来的病毒组编目工作提出了建议。
2022-07-14
纪立农+李俊桦+钟焕姿等:降糖药与糖尿病肠道菌群间的双向互作
① 100名2型糖尿病患者随机分两组,用阿卡波糖或维达列汀治疗6个月;② 两种药物引起了肠道菌群的药物特异性变化,以及共性变化(青春双歧杆菌增加,拟杆菌属和副拟杆菌属的5个菌种减少),阿卡波糖对菌群的影响更大;③ 纳入另一项独立试验表明,阿卡波糖治疗3和6个月时,微生物α多样性、物种和通路丰度的变化高度一致;④ 基线肠道菌群与治疗后(特别是维达列汀)的GLP-1反应相关,如PWY-6588途径(丙酮酸发酵生成丙酮)与GLP-1反应负相关。
2022-08-05
李俊桦+肖敏凤Cell子刊:一文读懂人类肠道病毒组编目的进展和挑战(综述)
① 基于发表的4个肠道病毒组数据库,发现噬菌体数量随样本量增加而增加,表明目前数据库病毒多样性未达到饱和;② 基于病毒宏基因组测序识别ssDNA、ssRNA和dsRNA噬菌体存在局限性;③ 编目病毒组数据库包括短reads组装、病毒contig鉴定,质量评估,注释和细菌宿主分配五大步骤;④ 超50%肠道病毒无法通过数据库注释到对应家族,基于基因组或基因聚类有望解决;⑤ 四个数据库采用对齐依赖法分配宿主,间隔数据库大小及对齐参数会影响宿主预测性能。
2022-07-13
王卫庆、李俊桦等:小檗碱+益生菌改善糖尿病患者的餐后血脂
① 纳入PREMOTE研究的365名2型糖尿病(T2D)受试者,评估益生菌(Prob,含9菌株)和小檗碱(BBR)联合治疗对餐后血脂的影响;② 干预12周后,与单独治疗相比,Prob+BBR联合治疗改善了患者的餐后血脂(降低总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇和多种脂质代谢物);③ 该效果与粪便中的短双歧杆菌(Bb)富集有关;④ Prob的Bb菌株中存在4个编码长链酰辅酶A合成酶的fadD基因,体外培养实验中,BBR能上调fadD基因表达,进一步降低培养基中的游离脂肪酸。
2021-12-20
国内团队:新冠重症患者的呼吸道菌群失调特征
① 收集广东省8例轻症和15例重症新冠住院患者的临床标本,进行超深度宏转录组测序和诊断分析;② 在4例重症患者中检测到其他人类呼吸道病毒,但在所有轻症患者中均未检出;③ 重症患者的主要呼吸微生物类群为洋葱伯克霍尔德菌群(BCC)、表皮葡萄球菌或支原体,3例重症病例呼吸道标本的临床培养证实存在前两类细菌;④ 在1名重症患者中检测到表达多种毒力因子的B. cenocepacia的继发性感染,或许加速了患者病情恶化并致其入院后1个月死亡。
2021-04-13
纪立农+李俊桦等:Nature子刊揭秘成年人肠道微生态“变迁史”
① 以北京平谷队列为基础,综合中国、以色列和荷兰超过5000名成年人的肠道微生态数据,发现成年人肠道菌群组成和变化具有普适的性别差异性;② 肠道微生态存在性别差异,绝经前女性的肠道菌群多样性显著高于同龄段男性,女性肠道中富集了更多对宿主代谢有益的微生物;③ 随着宿主年龄的增加,肠道微生态的性别差异逐渐缩小;④ 不同人种、性别间,肠道菌群随宿主年龄的变化具有一致性,肠道中出现的口腔共生菌群可作为指示宿主年龄的最优指标。
2021-01-14
王卫庆+李俊桦:小檗碱+益生菌,更好改善糖尿病
① 纳入409名2型糖尿病患者进行随机双盲对照试验,在庆大霉素预处理1周后,接受益生菌、小檗碱(BBR)、益生菌+BBR或安慰剂治疗12周;② 与安慰剂和单独使用益生菌相比,益生菌+BBR和单独使用BBR组的糖化血红蛋白改变更明显,益生菌能促进BBR对年长患者的血糖控制,BBR引起更多的胃肠副作用;③ BBR改变肠道菌群以及菌群相关的胆汁酸代谢(BA)和血液BA组成;④ BBR可能通过抑制布氏瘤胃球菌(R. bromii)产生次级胆汁酸DCA来发挥降血糖作用。
2020-10-06
国内团队:前驱糖尿病与未治疗2型糖尿病患者的肠道菌群变化
① 纳入77名未经治疗的2型糖尿病患者、80名前驱糖尿病患者、97名血糖正常受试者,分析对比肠道菌群组成及功能的差异;② 通过宏基因组分析揭示,3组受试者之间的肠道菌群组成及功能存在差异;③ 前驱糖尿病患者中大肠杆菌富集,而2型糖尿病患者中拟杆菌属的丰度升高,前驱糖尿病患者的肠道菌群中与能量代谢及细菌生长有关降低;④ 通过宏蛋白组分析揭示,2型糖尿病患者的粪便中,几种抗菌肽的水平显著降低。
2019-09-01
深圳华大生命科学研究院欧洲分院执行院长
深圳华大生命科学研究院研究员
深圳市未知病原体应急检测重点实验室主任
中国生物物理学会肠道菌群分会委员
中华预防医学会生物资源管理与利用研究分会委员
中国微生物学会病毒学专业委员会青年委员
李俊桦,博士,研究员,主要从事微生物组学、病原组学及相关生物信息分析技术研究。已发表高水平SCI文章60余篇,Google Scholar H-index 38,其中以第一作者/通讯作者在Nature Biotechnology,Cell Host &Microbe,Nature Communications,Nature Aging等国际高水平学术期刊发表论文35篇,共被SCIE收录论文引用2041次,其中他引1835次,4篇论文入选ESI高被引论文,单篇论文最高引用921次,入选科睿唯安(Clarivate)2019年度和2020年度全球“高被引科学家”。申请受理发明专利13项(其中PCT专利9项),获授权发明专利8项、实用新型专利1项,授权软件著作权11项。中国国家标准GB/T 40226-2021主要起草人。ISO/TC276/WG3&WG4工作组专家成员。学术期刊Microbiology Spectrum编委,学术期刊Frontiers in Medicine、Frontiers in Public Health副编辑(Associate Editor)。科技部、国自然基金委、广东省科技厅基金项目和人才项目评审专家库成员。Cell Host & Microbe、Nature Aging、Emerging Microbes & Infections、 Genome Medicine等多个国际学术期刊审稿专家。
2010~2015:华南理工大学,微生物学,博士
2006~2010:华南理工大学,软件工程,本科
2023.03~至今:深圳华大生命科学研究院,欧洲分院执行院长
2019.04~2023.03:深圳华大生命科学研究院,精准健康研究所副所长
2017.08~2019.03:深圳华大生命科学研究院,病原组学研究所负责人
2016.08~2017.07:深圳华大生命科学研究院,宏基因组研究所项目组负责人
2015.10~2016.07:深圳华大生命科学研究院,精准医学中心课题负责人
聚焦微生物组、病毒组、病原组研究及相关生物信息分析技术研发,致力于应用微生物组学、培养组学、生物信息学、合成生物学等创新技术,主要研究方向有:1)研究人体微生物组、病毒组与疾病的关系;2)挖掘潜在新病原体,并研究其组学特征;3)研发新型疾病干预手段。
2012年深圳市自然科学二等奖第二完成人
2019年中国生物信息学十大进展和十大应用第三完成人
科睿唯安(Clarivate)2019年度全球“高被引科学家”
科睿唯安(Clarivate)2020年度全球“高被引科学家”
2021年中国产学研合作创新成果奖一等奖第五完成人