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图形用户界面
文章数:2篇
Circos图
iMeta:国内团队开发绘制Circos图的交互式Web应用程序
本研究中,作者开发了shinyCircos-V2.0,这是shinyCircos的升级版本,包括了一个新的用户界面,增强了其易用性,并提供许多用于创建高级Circos图形的新功能。作者提供了详细的教程和示例输入数据集,应用程序在线网址为https://venyao.xyz/shinyCircos/和https://asiawang.shinyapps.io/shinyCircos/,也可以使用存放在GitHub中的源代码安装在本地使用(https://github.com/YaoLab-Bioinfo/shinyCircos-V2.0)。
Circos图
图形用户界面
易用性
Web应用程序
颜色图例
菌群数据
Nature子刊:使用mako快速灵活地分析关联的菌群数据
本研究,作者展示了 mako(微生物关联目录),其能够从菌群数据和元数据快速简单地构建网络数据库。Mako 通过基于语义网络本体的数据库模式提供标准菌群格式和 Neo4j 图数据库之间的接口,该软件包包括一系列与 Neo4j 数据库和基于模式的查询语言 Cypher 交互的方法,只需要基本的计算技能。此外,mako 包括一个 60 个从 QIITA6 下载的独立数据集衍生的精选数据库,QIITA6 是一个用于托管微生物研究的平台,有助于进行这种规模的宏分析。
菌群数据
图形数据库
网络数据库
宏分析
图形用户界面