菌群数据

搜索
登录

菌群数据

文章数：2篇

iMeta: 短读长扩增子测序是否适用于菌群功能的预测？

本文观点中，作者阐述了利用分类组成（特别是来源于短读长测序时）预测菌群功能之生物学可信度方面的一些担忧，讨论了标记基因的分类学分辨率、标记基因的基因组内变异以及菌群数据的组成性质。文中作者强调了功能预测对产生和验证假设的重要性。

组成数据功能潜力组成标记基因的基因组内变异性微生物功能菌群数据

Nature子刊：使用mako快速灵活地分析关联的菌群数据

本研究，作者展示了 mako（微生物关联目录），其能够从菌群数据和元数据快速简单地构建网络数据库。Mako 通过基于语义网络本体的数据库模式提供标准菌群格式和 Neo4j 图数据库之间的接口，该软件包包括一系列与 Neo4j 数据库和基于模式的查询语言 Cypher 交互的方法，只需要基本的计算技能。此外，mako 包括一个 60 个从 QIITA6 下载的独立数据集衍生的精选数据库，QIITA6 是一个用于托管微生物研究的平台，有助于进行这种规模的宏分析。

菌群数据图形数据库网络数据库宏分析图形用户界面