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网络数据库
文章数:1篇
菌群数据
Nature子刊:使用mako快速灵活地分析关联的菌群数据
本研究,作者展示了 mako(微生物关联目录),其能够从菌群数据和元数据快速简单地构建网络数据库。Mako 通过基于语义网络本体的数据库模式提供标准菌群格式和 Neo4j 图数据库之间的接口,该软件包包括一系列与 Neo4j 数据库和基于模式的查询语言 Cypher 交互的方法,只需要基本的计算技能。此外,mako 包括一个 60 个从 QIITA6 下载的独立数据集衍生的精选数据库,QIITA6 是一个用于托管微生物研究的平台,有助于进行这种规模的宏分析。
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