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细菌遗传学
文章数:3篇
细菌遗传学
Nature子刊:粪肠球菌如何感知ROS以调节蛋白质翻译?
细菌拥有复杂的系统来应对因暴露于哺乳动物免疫系统和环境压力而产生的活性氧(ROS)。Nature Communications近期发表的文章,发现在肠道共生菌和机会病原菌粪肠球菌中,RNA修饰酶——RlmN可感知ROS,并通过rRNA和tRNA的表观修饰直接调控翻译,将氧化应激压力传递到翻译调控。
细菌遗传学
活性氧(ROS)
RNA修饰酶
蛋白翻译
AKK菌
Nature子刊:Akk菌的首套遗传操作系统
这是发表在Nature Microbiology上的一份工作,作者基于pSAM_Bt质粒,密码子优化转座酶himar1C9成功构建针对嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akk菌)的转座子插入质粒pSAM_Akk,并通过大肠杆菌接合的方式获得了Akk菌的转座子插入突变文库。其中突变体混合文库包括721个基因序列上2680个独特插入、198个基因间序列插入和5个tRNA序列插入,单个突变体单独培养文库包括406个基因序列上1063插入、58个基因间序列插入和2个tRNA序列插入。通过混合文库分别接种到体外胃黏蛋白为唯一碳源的限制性培养基、体内四种小鼠模型(无菌小鼠、接种8种核心肠菌的小鼠、常规饲养小鼠和黏蛋白缺陷鼠)中,进行转座子测序以鉴定关键基因。Akk菌需要氨基酸生物合成途径以积累黏蛋白糖,同时表达大量糖苷水解酶以实现代谢生长。在体内,Akk菌表达纤毛和MUL外周蛋白复合体以实现黏蛋白的利用积累。MUL基因帮助Akk菌与其他肠菌竞争以实现定植,在无菌小鼠体内会抑制结肠甾醇生物合成相关基因的表达。这份工作成功实现了重要候选益生菌嗜黏蛋白阿克曼氏菌的遗传操作,为后续机理研究和益生菌开发提供技术基础。
AKK菌
细菌遗传学
细菌-宿主互作
菌株定殖
Nature:改造菌株+配套营养支持=可精细调控的菌株定殖
在稳定的肠道菌群中,益生菌等外来细菌不易定殖。了解哪些因素控制菌株植入和丰度,对于菌群干预有重要意义。来自斯坦福医学院的相关研究,本周在Nature上线。该研究表明,提供独享营养成分,是外源菌株在肠道内成功植入、实现对其丰度的精细调控的一种可行方法。这对肠道菌群研究,和基于肠道细菌/菌群的干预疗法都有重要意义。
菌株定殖
肠道菌群
细菌遗传学
Bacterial genetics
Microbiome