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生物地球化学
文章数:6篇
功能性状
METABOLIC:对微生物基因组的功能特征、新陈代谢、生物地球化学和群落尺度功能网络进行高通量分析
作者展示了 METABOLIC 软件(微生物的代谢和生物地球化学分析),它以基于基因组的微生物代谢为基础,能够对菌群生态学和生物地球化学进行一致且可重复的研究,并将推动未培养的生物体整合到代谢和生物地球化学模型中。作者预计 METABOLIC 将使从宏基因组和基因组中更容易解释微生物代谢和生物地球化学,并使菌群研究在不同领域成为可能。METABOLIC 是用 Perl 和 R 编写的,网址为 https://github.com/AnantharamanLab/METABOLIC。
功能性状
宏基因组组装基因组 (MAGs)
菌群
生物地球化学
代谢潜力
生物地球化学
Nature Reviews: 微生物与气候变化
在人类繁衍至今的地球上,大多数物种正遭受着气候变化的影响。微生物支持所有高等营养生命形式的存在。为了了解地球上的人类和其他生命形式(包括那些我们尚未发现的)如何能够抵御人为的气候变化--重要的是纳入对微生物的了解。我们不仅应该了解微生物如何影响气候变化(包括温室气体的生产和消耗),还应该了解它们将如何受到气候变化和其他人类活动的影响。这一共识声明记录了微生物在气候变化生物学中的核心作用以及其在全球范围内的重要性。它提醒人们,气候变化的影响将在很大程度上取决于微生物的响应,而微生物的响应对于实现环境可持续发展的未来至关重要。
生物地球化学
气候变化适应
气候变化影响
减缓气候变化
生态系统服务
生态系统
Science:数学模型+遗传学分析,研究微生物代谢
这是Science新发表的一篇小文章,作者是Science杂志的Insight系列主题文章创作比赛的优胜者,内容介绍了如何利用新的工具组合来充分研究微生物的代谢。很值得看看的文章,特别推荐。
生态系统
生物地球化学
代谢通路
海洋病毒
Nature:迄今为止最全的“全球海洋病毒组”数据集
近期nature上重要文章,对海洋病毒组的深入研究,在光合作用带及海洋中层共鉴定出15222个病毒种群,组成了867个病毒集群。强烈推荐阅读。
海洋病毒
经济
生物地球化学
Sabrina Duranti
Francesca Turroni
生物地球化学
微生物宏基因组揭示气候相关的地表下生物地球化学过程
① 宏基因组技术的发展使许多新的地表下的微生物及其在生物地球化学过程中的功能被发现;② 许多新发现的微生物有着极小的细胞体积及基因组,其代谢能力十分有限,需要与群落中的其他微生物共生;③ 许多新发现的微生物能够从水体催化温室气体(CO2,CH4和N2O)产生到达大气层,这些转化过程需不同代谢潜能的微生物合作;④ 气候变化与地表下微生物的相互影响值得关注,需结合基因组、转录组及蛋白组学技术探究地表下微生物互作的分子机制。
生物地球化学
气候
微生物
宏基因组
Omry Koren
海洋微生物组
Science:全球海洋微生物组(综述)
全年发表在Science的经典文献,对全球海洋微生物组进行系统性介绍,非常值得一看。
海洋微生物组
生物地球化学
Jane Peterson
Jane Peterson