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Ian T Paulsen
文章数:4篇
合成宏基因组
Nature子刊:在单个酵母中表达合成宏基因组(观点)
合成宏基因组学可以通过揭示单个细胞中捕获的微生物群落的简单性,来理解微生物生态系统的复杂性。因此从理论上来说,一个携带有代表性合成宏基因组的酵母细胞可以揭示多物种相互作用的复杂性,Nature Communications发表的观点文章,以酿酒酵母发酵产葡萄酒为例进行了说明。
合成宏基因组
酵母
膳食纤维
膳食纤维改变结肠粘蛋白O-糖基化及其与肠道菌群的互作
结肠粘液层中粘蛋白高度O-糖基化,在介导宿主-肠道菌群互作中发挥关键作用,但饮食变化如何影响结肠粘蛋白O-糖基化及其与菌群的互作尚未明确。Gut Microbes上发表的一项最新研究,发现膳食纤维可诱导小鼠的结肠粘蛋白O-糖基化发生变化,促进特定糖基化模式的形成以抑制粘液层降解。另外,膳食纤维摄入可改变小鼠的肠道菌群组成,且特定肠道细菌与结肠粘蛋白O-糖基化结构密切相关,提示膳食纤维可改变结肠粘蛋白与肠道菌群的互作。
膳食纤维
Gut microbiota
mucin O-glycosylation
glycan-microbiota interaction
dietary intervention
膳食纤维
纤维补充剂对肠道菌群的影响
来自Frontiers in Microbiology上发表的一项研究,在体外模拟消化系统中分析了三种不同纤维补充剂对肠道菌群的影响。
膳食纤维
膳食纤维
Qin Qin
Liang Qiao
Shuping Long
Phenotype
Biolog PM表型芯片用于微生物细胞的表型鉴定
① Biolog PM表型芯片为微生物生长表型的全方位分析提供一个高通量方法,其原理是利用显色反应在微孔板上测定单个菌株或微生物群落对不同营养物质和化学物质的反应;② 该技术可应用于检测与基因敲除相关的表型变化,进而研究基因功能并改善基因组的注释;③ 同时可应用于微生物群落的生理分析,包括研究不同自然环境或工业环境中微生物群落空间及瞬时特征;④ 该芯片还可用于代谢功能的研究,并可根据不同的研究需求进行个性化定制。
Phenotype
Biolog
Metabolic fingerprinting
Microplate assays
Susceptibility testing