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菌群关系变化

刘星吟团队：新的鉴定和量化菌群关系变化的分析框架—PM2RA

南京医科大学刘星吟教授课题组在Genomics, Proteomics & Bioinformatics杂志上在线发表了文章，借鉴工业领域监测变量之间关系一致性的方法，提出了一个鉴定和量化菌群关系变化的分析框架（PM2RA），以检测和量化各种条件下菌群中的关系变化。PM2RA无需构建共现网络，可直接比较不同条件下菌群关联的变化。为了方便临床医生以及没有生信基础的科研人员使用该软件进行两种状态下菌群关系的变化分析，PM2RA提供在线分析工具及单机版软件 http://www.pm2ra-xingyinliulab.cn/。

菌群关系变化整体监测共现网络人类疾病鲁棒性

系统回顾和荟萃分析

2007-2016年间NIH资助的人类微生物组研究

在2007-2016年间，美国国立卫生研究院（NIH）在人类微生物组计划（HMP）中累计投入了2.15亿美元。2012-2016年，NIH在HMP之外（nonHMP）又投入了7.28亿美元用于人类微生物组领域的其它研究。HMP计划关注口腔、皮肤、鼻孔、胃肠道和泌尿生殖道等5个栖息地，先期开展微生物群落调查，后期则关注菌群与疾病之间的密切联系；nonHMP是2012年后的更主要资金来源，侧重于研究疾病相关菌群，占总资助额度的64%。截至目前，这些项目均已完成，我们来一起看一下这些项目都取得了哪些成果，已有研究对未来又有何启示。

系统回顾和荟萃分析 animal models Fast Track Action Committee on Mapping the Microbiome (FTAC-MM) human microbiome project (HMP) Human disease