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病毒宏基因组学
文章数:3篇
模块化工具
iMeta:用于从宏基因组中识别、归类和预测病毒的宿主关系的模块化工具-ViWrap
作者开发了ViWrap,以研究人类和环境系统中的病毒。ViWrap将多种工具的功能整合到一个平台中,以实现病毒分析的各个步骤,包括识别、注释、基因组分组、物种和属水平聚类、分类学分配、宿主预测、基因组质量的表征、综合总结和直观的结果可视化。ViWrap可通过GitHub(https://github.com/AnantharamanLab/ViWrap)公开获取。有关软件的详细描述、使用方法和结果解释可以在该网站上找到。
模块化工具
宿主关系
病毒宏基因组学
数据库
宿主预测
流式细胞仪分选
iMeta:新加坡城市污水处理厂中流式细胞仪分类群落和鸟枪法病毒宏基因组学的比较研究
本研究阐明了荧光激活细胞分选(FACS)和宏基因组学应用于DNA和RNA病毒的实际方案,这是第一次采用改良的Ludzack-Ettinger (MLE)工艺系统地分析城市污水处理厂的病毒宏基因组。将FACS与宏基因组学相结合,改善了某些罕见病毒物种的检测和基因组组装。传统病毒宏基因组学和FACS耦合宏基因组学提供了互补的结果。
流式细胞仪分选
改良的Ludzack-Ettinger (MLE)工艺
病毒宏基因组学
污水
病毒宏基因组学
FM:水生生物研究中的病毒宏基因组(综述)
研究菌群,不能忽视病毒组,这个综述关注于水生生物研究中的病毒宏基因组,值得一读。
病毒宏基因组学
水生生物