宿主预测

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模块化工具

iMeta：用于从宏基因组中识别、归类和预测病毒的宿主关系的模块化工具-ViWrap

作者开发了ViWrap，以研究人类和环境系统中的病毒。ViWrap将多种工具的功能整合到一个平台中，以实现病毒分析的各个步骤，包括识别、注释、基因组分组、物种和属水平聚类、分类学分配、宿主预测、基因组质量的表征、综合总结和直观的结果可视化。ViWrap可通过GitHub（https://github.com/AnantharamanLab/ViWrap）公开获取。有关软件的详细描述、使用方法和结果解释可以在该网站上找到。

模块化工具宿主关系病毒宏基因组学数据库宿主预测

图卷积网络(GCN)

香港城市大学：使用基于GCN的半监督学习预测原核病毒的宿主

在本研究中，香港城市大学孙燕妮团队提出了一个名为 HostG 的半监督学习模型，用于对新型病毒进行宿主预测。作者在模拟和真实测序数据上测试了 HostG，结果表明它优于最先进的流程。这项工作将有助于识别宏基因组数据中的病毒-宿主相互作用，并将扩展我们对新发现的病毒的理解。HostG 的源代码位于：https://github.com/KennthShang/HostG。

图卷积网络(GCN) 半监督学习模型原核病毒宿主预测序列比对

IMG/VR数据库

IMG/VR v3：一个用于查询未培养病毒基因组的综合生态和进化框架

本研究中，作者提出了IMG/VR的第三个版本，其由18,373个培养的病毒基因组和2,314,329个未培养的病毒基因组(UViGs)组成，与之前的版本相比，序列总数几乎增加了两倍。新的IMG/VR界面使用户能够根据基因组特征和/或序列相似度有效地浏览、搜索和选择UViG。IMG/VR v3可在 https://img.jgi.doe.gov/vr 登入，基础数据可在 https://genome.jgi.doe.gov/portal/IMG_VR 下载，完整的 IMG/VR 数据库可在 https://genome.jgi.doe.gov/portal/pages/dynamicOrganismDownload.jsf?organism=IMG_VR 上下载。

IMG/VR数据库病毒基因组基因组质量评估功能注释宿主预测