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Nature子刊：营养和宿主环境决定肠道合成菌群的群落生态和关键物种

了解与健康和疾病相关的微生物组特征中一项具有挑战性的任务是超越描述性的群落水平分析，转向解开微生物相互作用网络。近日，德国慕尼黑大学医学院研究人员在Nature Communications发表最新研究，使用体外分批培养法分析了OMM12合成菌群在不同培养基中的群落组成，发现营养和宿主环境会决定肠道合成菌群的群落生态和关键物种，值得关注。

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体外培养需要注意培养基成分

① 文章采用了正交实验设计与蛋白组学分析的方法；② 蛋白组学分析对不同培养基成分，如无机盐、胆汁盐、粘蛋白以及短链脂肪酸的应答不同；③ 多因素方差分析显示无机盐、胆汁酸以及粘蛋白对不同功能性肠道菌群蛋白组有显著的主要和相互作用；④ 培养基成分对基础代谢通路有广泛的调节作用；同时，不同的培养基成分对细胞壁、细胞膜以及包膜的生物合成，细胞功能性迁移也有调节作用；尤其是鞭毛合成相关蛋白对黏蛋白的存在有显著回应。

肠道菌群肠道菌群体外培养培养基正交实验设计蛋白质组学