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Diana M Proctor
文章数:2篇
生物信息学工具
R软件包 decontam 可用于去除污染序列
基于污染序列特征,在结果分析时去除污染序列的生物信息学工具 decontam 应该不仅仅会提高分析结果的准确性,或许还能发现那些实验本身存在问题的数据集。
生物信息学工具
16S rRNA gene
DNA contamination
Marker-gene
metagenomics
口腔菌群
Nature子刊:唾液影响口腔细菌的空间分布
菌群领域研究火热,但对菌群在组织器官中的空间分布还所知甚少。Nature Communications[IF:12.124]本月上线了斯坦福大学医学院大牛David Relman主导的研究,对口腔菌群的空间分布模式进行了分析,发现存在一种从前到后(门牙到臼齿)的梯度变化规律,唾液可对这种模式的形成有重要影响。这些发现,或为研究身体其他部位菌群的空间分布及其对健康的作用提供参考。
口腔菌群
空间分布
唾液