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空间分布
文章数:6篇
食品安全
华中农大:中国大米中有机磷酸酯的存在、分布和人群暴露风险
有机磷酸酯(OPEs)被广泛用作阻燃剂、抗氧化剂和增塑剂,在使用过程中很容易释放到环境中,因而在水、土壤、灰尘等环境基质中广泛存在。水、土壤中残留的OPEs可被植物吸收,动物、人食用受污染的植物后即在体内积累OPEs。华中农业大学刘春生教授(现在中国地质大学(武汉))团队近日在Science of the Total Environment发表研究文章,系统测定了中国25个省市的234份大米样品中24种OPEs的浓度,描绘了中国大米的OPEs污染及其空间分布图谱,并对中国成人及儿童OPEs的暴露风险进行了评估。
食品安全
研究论文
有机磷酸酯(OPEs)
大米
有害物质
肿瘤菌群
Nature:瘤内菌群的空间分布,如何影响肿瘤异质性
肿瘤相关微生物群是肿瘤微环境的重要组成部分。然而,瘤内菌群的研究此前主要依赖于对整块(bulk)组织的分析,这掩盖了瘤内菌群的空间分布和对局部的影响。Nature最新发表的这项研究,通过空间转录组学和单细胞RNA测序方法,分析了口腔鳞癌和结直肠癌患者的肿瘤样本,并结合功能研究,发现瘤内菌群的空间分布不是随机的,其在肿瘤内的分布模式与肿瘤微环境的异质性密切相关。特定细菌对瘤内细胞的感染/黏附可以在单细胞层面改变细胞特征,并可能通过影响抗肿瘤免疫和癌细胞转移,促进癌症进展。
肿瘤菌群
空间分布
空间转录组学
单细胞RNA测序
宿主-菌群互作
回肠上皮细胞
Nature子刊:肠上皮的RNA是否能可靠地指代蛋白质?
使用转录组作为蛋白质组的可替代指标一直存在争议。空间转录组学已证明肠细胞基因表达有显著的分区现象,但这种分区性如何转化为蛋白质的含量尚不清楚。近期Nature Metabolism发表的研究显示,肠细胞沿着绒毛轴的蛋白和mRNA常常在空间上存在不一致性。许多基因的蛋白质呈带状分布于绒毛尖端,但mRNA呈带状分布于绒毛底部。该研究证明的不依赖空间的蛋白质合成延迟可以解释许多mRNA-protein不一致性的问题,并强调了利用肠上皮的蛋白质空间组学对于推断非稳态下的组织或细胞状态的重要性。
回肠上皮细胞
RNA与蛋白质的不一致性
空间分布
蛋白合成延迟
口腔菌群
Nature子刊:唾液影响口腔细菌的空间分布
菌群领域研究火热,但对菌群在组织器官中的空间分布还所知甚少。Nature Communications[IF:12.124]本月上线了斯坦福大学医学院大牛David Relman主导的研究,对口腔菌群的空间分布模式进行了分析,发现存在一种从前到后(门牙到臼齿)的梯度变化规律,唾液可对这种模式的形成有重要影响。这些发现,或为研究身体其他部位菌群的空间分布及其对健康的作用提供参考。
口腔菌群
空间分布
唾液
空间分布
PNAS:“看到”肠道细菌的空间分布
这是Jeffrey I Gordon等人在9月发表在PNAS的重要研究,通过将已知菌群移植到小鼠并利用原位杂交及光谱成像分析研究不同菌株的空间分布情况。文章五颜六色,看起来漂亮,更令人激动!相关技术会推动肠道菌群的研究变得可视化,进而更深入。
空间分布
Wentao Jiao
Xin Jiang
Mao Ye
多药耐药
【耐药专题】Nature子刊:肺结核药物的杀菌活性与药物在病灶内的分布相关
① 重要杀菌药物——利福平和吡嗪酰胺可有效渗透进入肺结核(TB)病灶中的感染部位;② 利福平亦聚集于干酪样坏死区,后者是结核杆菌持续存在的重要部位;③ 莫西沙星在干酪样坏死病灶内未检出,与近期临床试验中无法缩短治疗时间的结果相关;④ 杀菌药物在空间分布上的差异及在病灶内聚集的动力学,导致在特定生态位形成单药治疗的时间和空间窗,使多药耐药性TB得以逐渐发展;⑤ 提出基于TB药物的定量及空间分布,建立新工作模型以研发新抗生素。
多药耐药
生态位
空间分布
肺结核