菌群分析

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菌群分析

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高通量测序分析

菌群测序数据该怎么合理分析？

① 微生物数据集是多样本组合数据，不能反映单种菌群的绝对含量；测序仪读取数据是基于菌群相关分子的统计值，片段测定再重组的测序方式不能反映真实的菌群组成；② 传统的距离和差异分析法没能考虑数据的集合性特点，并且关注的是菌群相对丰度的主要变化，而不是更重要的样本间的最大变化；组合数据的相关性分析在亚群和数据组装上存在欺骗性；相对丰度分析对极值敏感，可能带来特错数据；③ 可替代分析方法有元转录组分析法和标签测序法。

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