高通量测序分析

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高通量测序分析

文章数：3篇

人体十二指肠菌群

Cell子刊：小肠菌群与衰老密切相关

人肠道内驻留着约有3.83万亿的各种微生物，对人类健康发挥着重要的作用。肠道菌群异常会导致包括炎症性肠病、2型糖尿病等疾病的发生。此前人们一直认为肠道菌群在个体成年后会相对稳定，但近期有报道显示肠道菌群的组成变化与衰老有关。但是，目前大多关于肠道菌群的研究均是通过对个体大便中的微生物进行，远远不能体现肠道菌群的情况。最近一篇发表在Cell子刊Cell Reports上的研究，通过其实验室此前建立的有效检测小肠内不同区段肠道微生物的方法，针对18-80岁的人群队列的小肠菌群进行了分析，结果显示随着年龄和衰老的过程，小肠菌群发生了巨大的变化，包括有多样性降低，变形菌和大肠杆菌增多。这些结果为通过小肠菌群干预缓解年龄对代谢和免疫功能的影响提供了重要的理论依据。

人体十二指肠菌群生理年龄伴随疾病用药情况衰老进程

Nature子刊：测序技术助力非侵入性产前检查

目前非侵入性产前检查多用于筛查胎儿的染色体异常，对常见的显性单基因遗传病的筛查尚缺乏更优的方法。本研究构造了一种新的非侵入性DNA测序手段，通过对母亲血浆中游离DNA的测序和分析，发现其可能有助于新生儿显性单基因遗传病的筛查。该研究结论值得进一步验证和推广。

无创检测高通量测序分析基因组学孕妇胎儿

高通量测序分析

菌群测序数据该怎么合理分析？

① 微生物数据集是多样本组合数据，不能反映单种菌群的绝对含量；测序仪读取数据是基于菌群相关分子的统计值，片段测定再重组的测序方式不能反映真实的菌群组成；② 传统的距离和差异分析法没能考虑数据的集合性特点，并且关注的是菌群相对丰度的主要变化，而不是更重要的样本间的最大变化；组合数据的相关性分析在亚群和数据组装上存在欺骗性；相对丰度分析对极值敏感，可能带来特错数据；③ 可替代分析方法有元转录组分析法和标签测序法。

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