测序分析

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NEJM：疾控中心报道武汉新型冠状病毒研究情况

本论文是由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心主任谭文杰、中国疾病预防控制中心主任高福、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所党委书记武桂珍作为共同通讯作者于2020年1月24日联合发表在新英格兰医学杂志上，其报告了一种新的冠状病毒（2019-nCoV），该病毒的存在证据包括通过全基因组测序在三名患者的支气管肺泡灌洗液中进行鉴定，直接PCR和培养。该冠状病毒可能引起的疾病被称为“新型冠状病毒感染的肺炎”（NCIP）。本文分析提供了2019-nCoV在武汉暴发的证据并报道了病毒的分离以及对其特定细胞病变效应和形态的初步描述。

冠状病毒肺炎病毒毒株细胞病变测序分析

高通量测序分析

菌群测序数据该怎么合理分析？

① 微生物数据集是多样本组合数据，不能反映单种菌群的绝对含量；测序仪读取数据是基于菌群相关分子的统计值，片段测定再重组的测序方式不能反映真实的菌群组成；② 传统的距离和差异分析法没能考虑数据的集合性特点，并且关注的是菌群相对丰度的主要变化，而不是更重要的样本间的最大变化；组合数据的相关性分析在亚群和数据组装上存在欺骗性；相对丰度分析对极值敏感，可能带来特错数据；③ 可替代分析方法有元转录组分析法和标签测序法。

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