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全基因组测序(WGS)
文章数:4篇
全基因组测序(WGS)
iMeta:国内团队开发可交互微生物鉴定和溯源分析平台—MIST
本研究开发了一体化微生物鉴定系统MIST(http://syj.i-sanger.cn),MIST集成了三种分析流程:基于16S/18S/ITS扩增子的微生物鉴定、基于WGS(全基因组测序)的微生物鉴定和SNP(基于单核苷酸多态性)的微生物溯源追踪。作者还为MIST 开发了一个可公开访问的Web分析平台,用户可在线开展数据分析工作。
全基因组测序(WGS)
单核苷酸多态性
毒力因子基因
溯源分析
基因注释
胰腺癌
Nature子刊:RABL3突变——遗传性胰腺癌元凶
胰腺导管腺癌(PDAC)作为侵略性较强的癌症,目前可供选择的治疗方法极为有限。10%左右的PDAC表现出家族遗传倾向,但在绝大多数罹患PDAC的家族中,致癌驱动基因尚不明确。最新发表在Nature Genetics上的研究利用全基因组测序技术分析了某一多位成员罹患PDAC的家族,发现该家族PDAC发生与RABL3基因截短突变相关。该研究证实了RABL3可以作为癌症家族进行遗传检测的目标,同时揭露了在机体发育和肿瘤发生过程中RAS异常活化的机理。
胰腺癌
全基因组测序(WGS)
RABL3
RAS
异戊烯化
技术转化
微生物全基因组测序技术离临床运用还有多远?(综述)
全基因组测序(WGS)的精确性,可提供从菌株/表型鉴定到来源的相关信息,但在临床感染诊疗领域缺乏广泛运用。本文回顾了WGS转化为临床运用过程的多个瓶颈和问题,并提出了若干解决方法,为WGS后续的临床应用与技术转化提供了可参考的方案。
技术转化
全基因组测序(WGS)
临床运用
抗生素耐药
表型鉴定
抗生素耐药性
Science:全基因组测序指导细菌耐药性防控
本文回顾了一系列运用全基因组测序技术进行的耐药致病菌株跟踪、溯源研究,指出从菌株水平而言,各地区内致病菌耐药性的产生的传播具有类似的规律性,并强调了医院感染、社区性传播感染、食物链相关耐药细菌在耐药致病菌产生和传播中的重要作用。全基因测序技术对于预测耐药性产生与传播、指导合理用药具有重要价值,值得专业人士参考。
抗生素耐药性
全基因组测序(WGS)
致病菌
Bohdan Pomahac