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单核苷酸多态性
文章数:3篇
全基因组测序(WGS)
iMeta:国内团队开发可交互微生物鉴定和溯源分析平台—MIST
本研究开发了一体化微生物鉴定系统MIST(http://syj.i-sanger.cn),MIST集成了三种分析流程:基于16S/18S/ITS扩增子的微生物鉴定、基于WGS(全基因组测序)的微生物鉴定和SNP(基于单核苷酸多态性)的微生物溯源追踪。作者还为MIST 开发了一个可公开访问的Web分析平台,用户可在线开展数据分析工作。
全基因组测序(WGS)
单核苷酸多态性
毒力因子基因
溯源分析
基因注释
肥胖
FMN1/GREM区域遗传位点与BMI对结直肠癌症风险的交互作用
肥胖会促进结直肠癌患病风险,但其与遗传因素是否对结直肠癌风险存在交互作用尚未被完全阐明。近日,华盛顿大学研究人员在Cancer Research发表最新研究,纳入来自三个大型国际结直肠癌联盟的数据,发现FMN1/GREM1基因区域遗传位点与BMI对结直肠癌症风险存在明显的交互作用。总之,该研究探讨了FMN1/GREM1基因区域遗传位点对肥胖与结直肠癌病因学关联的潜在作用机制,值得关注。
肥胖
遗传
研究论文
基础研究
单核苷酸多态性
结直肠癌
女性大肠癌风险或受体重指数和基因变体的影响
体重指数(BMI)是一种复杂的表型,可能与遗传变异相互作用,影响结直肠癌(CRC)的风险。最新发表在Journal of the National Cancer Institute的研究分析了BMI和单核苷酸多态性(SNPs)与CRC风险之间的关系,发现女性的SMAD7基因在18q21.1位点(rs4939827)的内含子变体与BMI和CRC风险相关。SMAD7此前被认为是CRC易感位点,该发现提供一个新的视角,即SMAD7可能和BMI一起影响女性CRC风险。
结直肠癌
体重指数
单核苷酸多态性
患癌风险
Smad7