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Christina Warinner
文章数:3篇
细菌天然产物
Science:从古人牙结石中重建细菌基因组,挖掘天然产物
Science最新发表的一项研究,从远至旧石器时代的古人类牙结石样本中,成功重建了上百个细菌的宏基因组组装基因组,并通过分析研究这些细菌基因组中的生物合成基因簇,发现了一类新的天然产物。这些发现表明从古样本中研究微生物的生物合成机制具有可行性,为探索天然产物扩展了新的方向。
细菌天然产物
古人类
牙结石菌群
生物合成基因簇
口腔菌群
牙菌斑及牙结石菌群的差异
来自Microbiome上发表的一项最新研究,分析对比了牙菌斑与牙结石菌群组成及功能的差异,并对比了现代人与古代人的牙结石菌群。
口腔菌群
Ancient dental calculus
metagenomics
Metaproteomics
Oral microbiome
微生物考古学
ARGHG:如何进行微生物考古学研究(综述)
① 在高通量测序时代,微生物考古学盛行,揭示毁灭性的历史瘟疫背后的病原体、鉴定史前病原体的神秘变化、重组人类祖先的菌群;② 本综述引入学科的基本概念和理论框架,讨论从考古学样本中进行病原学鉴定和菌群特征描述的方法学;③ 微生物考古学研究分为二大类:病原基因组学及微生物组研究;④ 特别关注采用高通量DNA测序数据进行鉴别、证实、鉴定的程序;⑤ 最后,概述指导该领域进一步研究的七个标准和预防措施。
微生物考古学
古DNA
ancient DNA
metagenomics
Microbiology