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文章数：3篇

人肠道细菌

Cell子刊：揭秘西化人群中缺乏的Prevotella copri

Prevotella copri是常见的人类肠道细菌，尤其存在于非西化人群中，这种菌在健康与疾病中的作用仍有不小的争议。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究，分析了超过7000个宏基因组中>1000个P. copri基因组，结合对古人类化石样本的分析，充分揭示了这种菌的种内多样性和在不同人群中（西化vs非西化）的存在情况，及其与人类共生的进化史，表明西化进程（尤其是相关的饮食变化）可能导致了这种菌在人类肠道中不断减少。

人肠道细菌 human microbiome metagenomics Prevotella copri comparative microbial genomics

古生物基因

可鉴别古生物DNA的新工具

新开发的FALCON-meta宏基因组分析平台可通过比对DNA损坏程度，鉴别样品中序列来自古生物还是现代生物DNA污染，对降低古生物宏基因组序列噪音具有重要作用，值得参考。

古生物基因 ancient DNA composition analysis polar bear metagenomics

微生物考古学

ARGHG：如何进行微生物考古学研究（综述）

① 在高通量测序时代，微生物考古学盛行，揭示毁灭性的历史瘟疫背后的病原体、鉴定史前病原体的神秘变化、重组人类祖先的菌群；② 本综述引入学科的基本概念和理论框架，讨论从考古学样本中进行病原学鉴定和菌群特征描述的方法学；③ 微生物考古学研究分为二大类：病原基因组学及微生物组研究；④ 特别关注采用高通量DNA测序数据进行鉴别、证实、鉴定的程序；⑤ 最后，概述指导该领域进一步研究的七个标准和预防措施。

微生物考古学古DNA ancient DNA metagenomics Microbiology