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人肠道细菌
文章数:5篇
直肠真杆菌
从宏基因组中重构1321个直肠真杆菌基因组,发现了什么?
直肠真杆菌是一种属于毛螺菌科细菌,广泛存在于人类肠道菌群中。《Genome Biology》发表的一项研究,建立了一种宏基因组分析流程,从>6500个粪便宏基因组中重构了1321个高质量的直肠真杆菌基因组,并分析了这种细菌的种群结构和分布。
直肠真杆菌
宏基因组
系统发生生物地理学
人肠道细菌
人肠道细菌
Cell子刊:揭秘西化人群中缺乏的Prevotella copri
Prevotella copri是常见的人类肠道细菌,尤其存在于非西化人群中,这种菌在健康与疾病中的作用仍有不小的争议。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究,分析了超过7000个宏基因组中>1000个P. copri基因组,结合对古人类化石样本的分析,充分揭示了这种菌的种内多样性和在不同人群中(西化vs非西化)的存在情况,及其与人类共生的进化史,表明西化进程(尤其是相关的饮食变化)可能导致了这种菌在人类肠道中不断减少。
人肠道细菌
human microbiome
metagenomics
Prevotella copri
comparative microbial genomics
基因编辑
中国科学院:肠道细菌Ago蛋白或可用于哺乳动物基因编辑
大多数原核Ago蛋白(pAgo)如TtAgo、PfAgo、MjAgo等来自嗜热菌,在65°C以上的温度下发挥最佳功能,这一特性使得它们无法被用作包括人类在内的哺乳动物的基因组编辑工具。中科院动物研究所王皓毅团队和中科院北京生命科学研究院赵方庆团队合作发表在《Cell Discovery》上的研究鉴定了来自人肠道细菌的Ago蛋白CpAgo和IbAgo,37°C时可在gDNA引导下实现对单链和双链DNA的切割,其中CpAgo还可在gDNA引导下实现对RNA靶向切割。这两种新的pAgo蛋白的发现为开发用于精确编辑DNA序列的新工具提供了可能。
基因编辑
人肠道细菌
Argonaute protein
Intestinibacter bartlettii
Clostridium perfringens
果胶降解细菌
人肠道中存在专性降解果胶的细菌
果胶是水果蔬菜中的重要成分,一度被认为由肠道中的多能多聚糖降级细菌分解。本研究在人肠道中发现了一种专性降解果胶的细菌Monoglobus pectinilyticus。这种细菌的存在可能与肠道菌群适应人类高果胶饮食的过程有关,填补了专性果胶降解细菌的空白,值得参考。
果胶降解细菌
Monoglobus pectinilyticus
基因组分析
蛋白质组学
人肠道细菌
人肠道细菌
揭秘肠道细菌的硫化氢生成过程
肠道菌群产生的硫化氢对人体健康具有重要影响。本研究阐释了肠道条件致病菌沃氏嗜胆菌中的硫化氢生成途径,坚定了其中的关键酶——羟乙基磺酸亚硫酸盐裂解酶(IslA)。本文结果对调控肠道硫化氢产量、控制沃氏嗜胆菌感染具有参考价值。
人肠道细菌
无氧呼吸
anaerobic degradation
carbon-sulfur bond-cleaving glycyl radical enzyme
human gut microbiome