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细菌天然产物
文章数:9篇
细菌天然产物
Science:从古人牙结石中重建细菌基因组,挖掘天然产物
Science最新发表的一项研究,从远至旧石器时代的古人类牙结石样本中,成功重建了上百个细菌的宏基因组组装基因组,并通过分析研究这些细菌基因组中的生物合成基因簇,发现了一类新的天然产物。这些发现表明从古样本中研究微生物的生物合成机制具有可行性,为探索天然产物扩展了新的方向。
细菌天然产物
古人类
牙结石菌群
生物合成基因簇
CRISPRi技术
Nature子刊:使用CRISPRi技术从复杂文库中高通量检索所需序列
随着测序技术的快速发展,从宏基因组文库中捕获DNA为探究微生物多样性提供了新机遇,目前构建大型宏基因组文库中靶向检索克隆仍需要多步稀释和PCR筛选,严重阻碍了进程。 CRISPR-Cas已被用于精确克隆目标基因组序列,但还未能从复杂的宏基因组库中访问序列。近日,美国洛克菲勒大学在Nature Biotechnology发表最新研究,利用核酸酶活性缺失的Cas9建立了一个CRISPR反筛选中断线路,可高效的从复杂文库中检索目标克隆。总之,该研究为科研人员挖掘以前无法接触到的微生物群落多样性提供了新工具,值得关注和尝试。
CRISPRi技术
遗传多样性
研究论文
基础研究
细菌天然产物
肠菌代谢物
Nature子刊:肠肽是含有N-甲基甲鸟氨酸的替代肽
随着测序技术及生物信息学的快速发展,已经成为研究人员识别肠菌天然产物的两把利刃。近日,美国普林斯顿大学研究人员在Nature Chemistry发表最新研究,借助生信手段搜索在被忽视的链球菌中鉴定出约600个基因簇,这些基因簇编码由自由基S-腺苷蛋氨酸酶合成的核糖体肽天然产物,还识别出肠肽的一个新化学类型,建议命名4型塞克肽类,并探究肠肽相关的抑菌活性。总之,该研究为未来进一步探究肠菌相关天然产物提供了新的思路。
肠菌代谢物
肠肽
研究论文
基础研究
细菌天然产物
药物发现
Nature Reviews:利用细菌基因组进行药物发现(综述)
Nature Reviews Drug Discovery上发表的一篇综述文章,详细介绍了从细菌基因组中寻找新天然产物的方法,并讨论了从难以培养的细菌中挖掘新天然产物的新兴技术手段。
药物发现
综述
细菌天然产物
抗真菌药物
Science:从海洋菌群挖掘新型抗真菌药
海洋细菌能产生大量的天然产物,Science发表的一项最新研究,从海鞘微生物组中锁定了一种有强效抗真菌作用的细菌产物——turbinmicin,能有效抑制对人类健康造成威胁的多重耐药真菌,且在小鼠模型中有良好的安全性,或能研发为新型抗真菌药。
抗真菌药物
海洋微生物组
细菌天然产物
细菌天然产物
Nature Reviews:细菌——活性天然产物的生物工厂(综述)
细菌是活性天然产物的重要来源。细菌通过多样化的生物合成途径,产生多种多样的初级和次级代谢产物,这些代谢产物不仅对细菌的生存至关重要,同时也是人类的资源宝库。《Nature Reviews Chemistry》近期发表的长篇综述,详细介绍了细菌作为“生物工厂”在不同领域的应用,讨论了多样化的细菌次级代谢产物及其生物合成途径,论述了用细菌靶向基因工程技术生产生物活性化合物的最新进展。
细菌天然产物
次级代谢物
生物合成
基因工程
工程菌
细菌天然产物
Cell子刊:寻找人体菌群中的活性天然产物(综述)
Cell Host and Microbe上发表的一篇最新综述文章,详细介绍了通过宏基因组学、功能基因组学、代谢组学等方法,从人体菌群中寻找生物活性天然代谢产物的方法及案例,推荐阅读。
细菌天然产物
功能宏基因组
代谢组学
宏基因组学
细菌天然产物
TB:在放线菌中寻找细菌天然产物
这是 Trends in Biotechnology[IF:11.126]发表的关于利用基因组分析技术在特定细菌中寻找天然生物活性物质的文献,值得关注在细菌中“寻宝”的专业人士好好读一读。
细菌天然产物
放线菌
actinomycetes
genomics
mining
纬度
PNAS:纬度或是土壤细菌生物合成结构域的最大影响因素
这是PNAS发表的关于影响土壤菌群生物合成结构域的因素的研究,认为纬度可能是其中的最大因素。值得关注,特别推荐土壤相关微生物专业人士阅读。
纬度
细菌天然产物
chemical biogeography
continental soil analysis
eDNA