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Peer Bork
文章数:3篇
宏基因组分析工具
NGLess语言实现快速可重复分析宏基因组的流程NG-meta-profiler
本文是EMBL的生信大佬Peer Bork教授团队开发的可重复分析框架,并搭建了宏基因组分析的快速有参分析流程,方便同行实现主要物种肠道微生物组功能组成的快速分析。
宏基因组分析工具
口腔细菌
口腔健康别忽视!大多数口腔菌能在肠道安家
“病从口入”,《eLife》的一项最新研究似乎再次证实了这一点。该研究对比了470名参与者的唾液和粪便菌种,并在菌株水平分析了细菌从口入肠的情况,证实了肠道中定植部分机会致病菌是来自口腔,提示口腔菌群对肠道菌群健康的影响不容小觑。
口腔细菌
computational biology
Human
infectious disease
Microbiology
基因组互作网络
赵立平团队:先天肥胖?不怕,用饮食纠正!
① 纳入17名普瑞德-威利综合征(PWS,遗传性肥胖)和21名单纯性肥胖儿童,进行干预试验;② 富含不易消化的碳水化合物的饮食可引起体重下降及肠道菌群结构变化,降低血清抗原负荷,减轻炎症,增加醋酸盐生成水平,降低N-氧化三甲胺和硫酸吲哚氧基水平;③ PWS儿童饮食干预前的菌群移植到无菌小鼠导致炎症及脂肪细胞增加;④ 儿童遗传性和单纯性肥胖都存在有害肠道菌群的参与;⑤ 饮食干预促进有益菌增殖,减少毒素产生,减轻肥胖患者的代谢恶化。
基因组互作网络
肠道菌群
代谢组学
宏基因组学
肥胖