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Human
文章数:20篇
低聚糖
高分辨时间剖面揭示菌群-低聚糖互作
研究利用高分辨时间剖面以及MC-TIMME2模型对低聚糖干预的健康人群的肠道菌群进行追踪和分析。研究结果显示,不同低聚糖的干预下,肠道菌群呈现出一致、持续性且差异化的动态变化,且与干预的剂量和顺序无关。菌群对不同低聚糖的发酵代谢机制也不同。
低聚糖
Dynamics
gastrointestinal
Glycans
Human
人肠内分泌细胞
Cell:描绘人肠内分泌细胞的mRNA和分泌蛋白质组的高分辨率图谱
肠内分泌细胞(EEC)可感知肠道内容物并释放激素,调节胃肠道活动、全身代谢和食物的摄入。但EEC总体数量少且没有相关体外模型,对EEC各亚型及其分泌产物的研究具有挑战。近期发表在《Cell》的文章,创建了体外类器官诱导产生肠段特异性EEC和基因编辑标记EEC分泌激素的技术,绘制出人EEC表达图谱和分泌蛋白质组图谱,为深入了解人EEC的发育和功能提供了宝贵资料。
人肠内分泌细胞
mRNA图谱
分泌蛋白质组图谱
enteroendocrine cell
Organoids
肠道菌群与疾病
Cell:肠道菌群与人类疾病间的因果关系被夸大(观点)
人源菌群鼠模型(HMA)是体内植入人体肠道/粪便菌群的无菌鼠类模型,为目前研究肠道菌群和疾病之间因果关系的主流手段。现有大量使用HMA证明多种诸如炎症、过敏、肿瘤等与肠道菌群成因果关系,但已知在人体中能确定具有因果关系的只有两种:幽门螺旋杆菌导致人患胃癌和艰难梭菌感染导致人腹泻。作者认为啮齿动物无法还原人体,自身生理结构、处所和饮食等都会造成不同结果,因此对该领域的研究结论需谨慎说明。在这里补充原文作者提出的相关建议:1)探索HMA中与疾病相关的菌群变化;2)使用考虑了生物差异性的供体样本量量;3)要将供体的重复组数量考虑进实验设计中;4)不混合供体样本以确保个体间差异;5)确保菌群移植成功,如特定的“失衡”菌群特征是否在受体内出现;6)诚实探讨动物实验不足;7)相关性分析HMA多组学数据和可能的菌群特征后进行功能性实验;
肠道菌群与疾病
causality
Chronic disease
Dysbiosis
Fecal transplant
肠道芯片
可用于临床前药物评估的十二指肠肠道芯片
肠道中的药物代谢酶、药物转运蛋白等可能对药物的药代动力学、安全性及有效性产生影响。来自eLife上发表的一项最新研究,结合类器官与器官芯片技术,开发了一种十二指肠肠道芯片,可更好地预测肠道中CYP3A4介导的药物代谢、药物互作及药物转运蛋白的活性,为新药研发的临床前评估提供了新的工具。
肠道芯片
CYP3A4
Organs-on-Chips
Cell biology
drug metabolism
2型糖尿病
Cell子刊:减重可缓解2型糖尿病
Cell Metabolism介绍了一份非常有趣的研究。现已知通过减重缓解2型糖尿病症状的患者的肝脏脂肪和胰脏内部脂肪均显著降低,研究人员因此招募了57名T2D患者和25名健康对照,探究出现10年之久的“高热量饮食导致肝脏脂肪堆积、胰岛素抵抗及血糖水平增高“的双循环假说。57名患者在为期2年的研究(5个月低热量饮食和后续健康饮食)后分为3组,症状缓解并保持者、症状复发患者和症状未缓解患者,作者在多时间点比较了三组患者和对照组的体重、血糖指标、胰岛素水平、肝脏脂肪含量、VLDL1-TG、VLDL-1TG棕榈酸和胰腺脂肪含量,发现复发患者和未缓解患者的以上所有指标均先降后升或无降低,最终用人类实验证明了假说。本研究的亮点在于其使用低热量饮食减重的方法治疗2型糖尿病后,不仅进行跟踪调查,还将患者进一步区分为症状缓解者、未缓解患者和复发患者,分析他们的生理代谢指标。本研究既有纵向研究也有横向比较,在探究T2D的病理过程的同时也推动了“个性化医疗”的发展。
2型糖尿病
脂蛋白代谢
低热量饮食减重
type 2 diabetes
Human
植物乳杆菌Lp299v
荟萃分析显示植物乳杆菌Lp299v对促进铁的吸收或有裨益
预防缺铁性贫血(IDA)的策略有不同的效果。发表于Nutrients的一篇系统综述和荟萃分析审查了不同益生菌对人体铁吸收和铁状态相关标志物的影响。发现植物乳杆菌Lp299v显著提高人体对铁的吸收。
植物乳杆菌Lp299v
Human
iron absorption
iron status
probiotic.
肠道菌群
人口、环境、病理等多种因素如何影响健康个体中肠道菌群多样性
肠道菌群的多样性受多种因素的调节。Microbiome 上的这一研究通过整合问卷调查、血液指标测量、医疗记录等多种来源的数据,得出了110个与人口、医疗和环境相关的因素,包括人口学特征、生理指标、饮食习惯、生活习惯、医疗记录等六大类。这些指标被用于更全面评估不同因素对肠道菌群的影响。
肠道菌群
16S rRNA gene sequencing
Demographics
environment
GWAS
知识库
人类微生物组与疾病关联知识库构建的挑战(综述)
随着人类逐步揭示微生物组与健康、疾病之间的内在联系,相关的知识碎片越来越多。为了整合、固化这些成果,迫切需要构建一个微生物组-疾病的关联知识库。Microbiome上发表的这篇综述,介绍了知识库的结构、构建方法,认为现有的知识库和开发工具仍有很大改进空间。提出用计算机算法自动化从海量文献中提取信息是知识库构建的必然选项,其关键在于准确的识别已发表文献中微生物、疾病和确定二者之间的关系。
知识库
Natural language processing
Knowledge base
Microbes
Disease
蘑菇摄入
蘑菇摄入或可预防前列腺癌
体内体外实验表明蘑菇具有预防前列腺癌的潜在效果,但未有人群研究这两者的关系。International Journal of Cancer上发表的一项研究,合并分析了两个日本队列,发现较高的蘑菇摄入(每周≥3次)与较低的前列腺癌风险相关,该负相关关系在50岁及以上的人群中更为明显。
蘑菇摄入
mushroom
Prostate cancer
Human
cohort study
口腔细菌
口腔健康别忽视!大多数口腔菌能在肠道安家
“病从口入”,《eLife》的一项最新研究似乎再次证实了这一点。该研究对比了470名参与者的唾液和粪便菌种,并在菌株水平分析了细菌从口入肠的情况,证实了肠道中定植部分机会致病菌是来自口腔,提示口腔菌群对肠道菌群健康的影响不容小觑。
口腔细菌
computational biology
Human
infectious disease
Microbiology
胎儿发育
孕期吸烟和肥胖,干扰胎儿甲状腺发育
BMC Medicine近期发表研究,表明母亲吸烟和肥胖,可影响胎儿的甲状腺发育和内分泌功能,且这种影响具有性别特异性。
胎儿发育
development
Fetus
Human
maternal obesity
抗生素
菌群变化影响肠道氧化还原动态
eLife上发表的一项最新研究,发现抗生素处理小鼠后不仅改变肠道菌群组成,同时引起肠道氧化还原电势的变化,而菌群组成趋于正常后,氧化还原电势也恢复。
抗生素
氧化还原电势
antibiotics
Gut microbiota
Human
褐色脂肪组织
Cell子刊:褐色脂肪组织在餐后产热
Cell Metabolism上发表的一项最新研究,发现在进食后,褐色脂肪组织在胰岛素的作用下,倾向于摄取葡萄糖及循环脂肪酸,并产生生热作用。
褐色脂肪组织
餐后代谢
生热作用
脂代谢
brown fat
实验可重复性
具核梭杆菌在结直肠肿瘤中真的显著增加了吗?
来自eLife[IF:7.725]的一项重复研究报告,对具核梭杆菌与大肠癌的关联提出一点质疑。科学在不断地质疑和修正中前进,相信更多的研究最终会给出确定的答案。
实验可重复性
结直肠癌
具核梭杆菌
Fusobacterium nucleatum
Reproducibility Project: Cancer Biology
1型糖尿病
CR:1型糖尿病中,α细胞功能和基因表达受损
在许多1型糖尿病患者中,残存一些功能正常的β细胞,但α细胞的功能及基因表达却受损,导致胰高血糖素分泌不足。在啮齿动物中,胰腺α细胞可转化为β细胞。但在人类1型糖尿病患者中,α细胞因缺失了一些关键转录因子,难以发生相似的转化。
1型糖尿病
α细胞
β细胞
alpha cells
glucagon
后肠内胚层细胞
SCR:iPSC衍生的后肠祖细胞,可形成肠肝类器官
诱导性多功能干细胞(iPSC)可用于疾病的研究甚至治疗,近期Stem Cell Reports[IF:7.338]发表一项研究中,开发了一种方法,将iPSC诱导为可大量扩增的后肠内胚层细胞(PGEC),并用这些细胞培养出后肠和肝芽类器官,可在小鼠中治疗急性肝衰竭。
后肠内胚层细胞
类器官
诱导性多能干细胞
CDX2
Human
弯曲杆菌
EM:南非的海鸥,或传播病原菌和耐药基因!
这是一项在南非开展的研究,发现天上飞的海鸥,像地上走的和被人吃的其他动物一样,可能是病原菌和耐药基因传播的有效宿主。有趣并也是值得关注的研究,特别推荐!
弯曲杆菌
沙门氏菌
海鸥
耐药性
PFGE
Dietary precursor intake
MNFR:鱼/鸡蛋/牛肉/水果,如何影响TMAO和肠道菌群?
吃含TMAO的鱼类、含胆碱的鸡蛋、含肉碱的牛肉和作为对照的水果,人体内的TMAO和肠道菌群会有什么变化?这项研究很有意义,推荐给大家。
Dietary precursor intake
Gut microbiota
Human
Metabolism
Trimethylamine-N-oxide
植物乳杆菌P-8
不同年龄人群对植物乳杆菌P-8的肠道应答
内蒙古农业大学张和平团队在Nutrition发表的一项研究,分析了不同年龄段受试者(青年、中年、老年)对口服植物乳杆菌P-8干预的肠道应答情况,包括菌群、分泌型免疫球蛋白A(SIgA)、胆汁酸和短链脂肪酸等指标的变化。
植物乳杆菌P-8
益生菌
probiotics
lactobacillus plantarum
LP-8
酸奶
食用酸奶与成年人更好的饮食质量和代谢状况有关
发表于Nutrition Research的一项来自美国的人群观察研究,表明经常食用酸奶的人通常有着更高的饮食质量和更好的代谢水平。酸奶是多种微量营养素的良好来源,或能作为健康、平衡的饮食模式的一部分,帮助改善饮食质量和保持代谢健康。
酸奶
yogurt
milk
Diet
Nutrition status