Justin O'Grady

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Justin O'Grady

文章数：3篇

宏基因组病原检测

Nature子刊：纳米孔宏基因组测序，6小时快速诊断下呼吸道感染病原体

下呼吸道感染年导致300万人死亡且病原体类型广泛，目前基于培养的诊断需2~3天且敏感性较差。2019年7月Nature Biotechnology以《纳米孔上的临床宏基因组学》（Clinical metagenomics on a nanopore）为封面，刊登了英国东安格利亚大学Justin O'Grady博士及合作者共同发布的首个使用纳米孔技术的快速、经济的宏基因组测序方法，直接从患者呼吸道样本中准确快速地识别细菌病原体，并在6小时内准确检测抗性基因的突破性研究。

宏基因组病原检测纳米孔测序技术 Tianshu Han Ying Li Changhao Sun

抗生素耐药

综述：临床快速诊断感染病原和抗生素耐药检测的新技术

抗生素耐药是目前人类健康面临的最为严重的威胁之一。如果按照现在抗生素耐药的情况发展，到2050年，每年因抗生素耐药可能导致的死亡人数会超过一千万。而避免抗生素耐药的进一步加剧的一个重要的方面是在抗生素临床实践过程中尽可能的及早明确致病的病原菌及其对抗生素的易感性，从而开展有针对性的抗生素应用。目前临床对于病原诊断和药物敏感性检测的金标准还是培养法，但该方法耗时长，因此使得临床医生在面临急性感染时不得不采取广谱抗生素治疗法，从而进一步加剧了抗生素耐药的发生。近年来，针对病原的临床检测不断有新的方法涌现，一篇发表在Current Opinion in Microbiology的综述对这些方法进行回顾总结，以期进一步推动技术进步。

抗生素耐药病原快速检测药敏快速检测三代测序技术综述

基于cfDNA宏基因组测序实现灵敏、全面的病原检测

传统病原菌检测方法有周期长、覆盖面窄的明显弊病，使用宏基因组测序方法则可以做到非侵入性、快速和零死角覆盖。本文是对之前研究（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1049500643）的一篇评论。不仅阐述了cfDNA宏基因组检测的特点和优势，还指出这一方法的局限性：包括特异性较差可能产生较多假阳性，周转时间（53小时）仍然太长、成本较高，难以检测抗原决定簇，难以检测RNA病毒感染等。

宏基因组疾病检测脓毒症系统性细菌感染 Min Wang