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R William DePaolo
文章数:3篇
结直肠癌
Cell子刊:大肠息肉中,原本正常的共生菌可能“叛变”
特定肠道细菌已被证实可驱动肠道肿瘤的发生,如具核梭杆菌、pks+大肠杆菌,以及产毒脆弱拟杆菌(ETFB)等。但癌前息肉是否与特定的菌群特征相关,尚待深入研究。Cell Host and Microbe发表的一项最新研究发现,常见的肠道共生菌——非产毒脆弱拟杆菌(NTBF)在结肠息肉患者中增多,并揭示了患者中的NTBF菌株与无息肉者的NTBF菌株在基因和功能方面的差异。该研究提示,在早期的息肉发展过程中,失调和炎性的肠道微环境可能导致了促炎的NTBF菌株(而非抑制炎症的菌株)在患者中被选择性地富集,从而加剧了组织炎症,进一步促进有害/致癌菌的富集。
结直肠癌
结直肠息肉
黏膜菌群
脆弱拟杆菌
微生物scRNA-seq
Science:微生物的单细胞RNA测序技术
单细胞RNA测序(scRNA-seq)已成为鉴定真核生物基因表达的重要工具,但目前的方法与细菌不兼容。Science近期发表的文章,开发了微生物的单细胞RNA测序技术-microSPLiT,可用于革兰氏阴性和阳性菌的高通量基因表达检测,并在枯草芽孢杆菌中成功应用,为细菌群落中基因表达的高通量分析铺平道路。
微生物scRNA-seq
split-pool条形码技术
枯草芽孢杆菌
反复感染
Cell子刊:感染造成的“免疫疤痕”可引发IBD
什么引发了炎性肠病(IBD)?近期Science上的一项研究表明,反复低度感染食源性病菌,能给肠道免疫留下“疤痕”,导致持续的炎症,可能是诱发IBD的一个重要原因。Cell Host and Microbe[IF:14.946]对此发表了一篇短评,值得看看。
反复感染
食源性病原菌
炎症性肠病(IBD)
Luanluan Sun
Robert Clarke