表观基因组学

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表观基因组学

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人类肠道病毒组

微生物所王军组发表Nanopore三代测序人类肠道病毒组的方法

Oxford Nanopore 的测序技术已成功用于多种应用场景下的宏基因组测序。2020年5月8日，中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室，中国科学院微生物研究所王军教授课题组的曹佳宝博士等人在《Medicine in Microecology》杂志发表了题为“Profiling of Human Gut Virome with Oxford Nanopore Technology”的文章。作者利用纳米孔测序，基于纳米孔高通量测序PromethION平台开发出一套用于病毒颗粒物理富集、逆转录、随机扩增来分析人类肠道病毒的工作流程。结果发现使用Nanopore测序病毒DNA和扩增后的病毒DNA/cDNA可获得更长读长的序列，提供有关病毒多样性的更多信息，且许多病毒序列并不在当前数据库中。此外，使用Nanopore测序非扩增的病毒DNA可以对噬菌体的表观遗传修饰（甲基化）信号进行检测。

人类肠道病毒组富集扩增牛津纳米孔技术表观基因组学

原发灶不明恶性肿瘤

原发灶不明恶性肿瘤：基于表观遗传学的精准治疗

① 某些肿瘤患者组织学起源不明，或同一组织学类型和基因学特征，具有完全不同的行为，即表观遗传学背景不同所致；② 鉴定原发灶不明恶性肿瘤（CUP）的组织学起源，是表观基因组学在临床情境下解决诊断和治疗需求的实例，传统诊断程序仅能明确30%CUP的组织学起源，EPICUP可提高到87%；③ 表观遗传学指导的组织起源的预测可更准确地诊断CUP；④ 组织起源的预测提供的初步数据提示存在特定的遗传学改变，可用于特异性治疗，即可用于药物的靶点。

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