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Eli L Moss
文章数:3篇
三代测序
Nature子刊:超长DNA片段提取助力纳米孔测序对复杂环境单菌基因组的组装
基于二代测序让我们对复杂环境微生物群落组成和功能有了进一步的认识,然而更深层次的研究就需要从复杂环境中组装得到完整基因组,虽然三代测序准确率有待提升,但是却帮助我们将序列读长扩展到足够用的地步,可我们却还是无法从复杂环境中得到可用于三代测序的大片段DNA。因此,从复杂环境中组装完整基因组的工作,从样本提取就开始困难重重,本文提出了一整套方案,从样本提取到下游的生物信息学分析,带我们跨越障碍,组装高质量基因组。
三代测序
纳米孔测序技术
DNA提取方法
长片段DNA提取
混合组装
宏基因组
Nature子刊:新技术“读云”可获得高质量宏基因组序列
“读云”的核心是采用了微液滴封装技术降低了宏基因组复杂性,之后再结合现有方法测序和新算法组装。这相当于对宏基因组展开了一场“降维攻击”。
宏基因组
宏基因组算法
微液滴封装
新一代测序技术
C Bosetti
抗疟疾药物
【耐药专题】Nature:筛选新型多级抗疟疾药物
① 抗疟疾药物的2个主要来源是:天然产物及合成的化合物;② 本文介绍了一种新的筛选抗疟疾药物的方法:从一系列合成的化合物中,寻找那些与天然产物有着类似的3维结构特征的化合物;③ 在满足上述条件的化合物中,鉴定出了曾经被报道过的、以及未曾被报道过的作用机制,包括一系列双环氮杂环丁烷,能够抑制新的抗疟疾靶点——苯丙氨酰基tRNA合成酶;④ 这些化合物在小鼠中可在所有生活史阶段中表现出抗疟原虫活性。
抗疟疾药物