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Cell子刊：肠道粪杆菌属细菌的多样性

粪杆菌（Faecalibacterium）属细菌广泛存在于人体肠道中，在开发下一代益生菌（next-generation probiotics，NGPs）或生物治疗药物方面具有广阔前景。但对于其多样性的认识十分有限。发表在Current Biology上的一项研究通过宏基因组组装，系统分析了粪杆菌属细菌在人类肠道中的多样性以及与年龄、地理、疾病等的相关性，极大丰富了对该类细菌的认识。

粪杆菌属 Faecalibacterium prausnitzii gut microbiome strain diversity Pangenome

宏基因组分析方法

培养富集+测序可揭示肠道细菌核心及附属基因

《Microbiome》上发表的一项最新研究，报道了结合液体培养与鸟枪法测序，可研究肠道菌群中低丰度细菌的基因组，并通过此方法鉴定出了阴沟肠杆菌及大肠杆菌的耐药基因，并可推断基因水平转移可能性。该方法对于研究肠道细菌耐药性以及获得方式具有参考价值。

宏基因组分析方法 Microbiome antibiotic resistance Pangenome Metagenomics assembly comparative genomics