batch effect correction

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用于校正微生物组数据中批次效应的新工具—PLSDA-batch

多项研究发现微生物组数据很容易受到批次效应的影响，现有的批次效应校正方法主要是针对基因表达数据开发的，没有很好地考虑微生物组数据的固有特征。近日，澳大利亚墨尔本大学研究人员在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，开发了一种基于偏最小二乘判别分析（PLSDA）的多变量和非参数批量效应校正方法PLSDA-batch（https://github.com/EvaYiwenWang/PLSDAbatch），在真实和模拟数据中发现该工具在保留处理差异的同时可以有效消除批量差异，值得进一步测试。

校正工具 PLSDA-batch 研究论文基础研究生信工具

2型天然淋巴细胞

Cell子刊：神经肽α-CGRP调节肠道ILC2应答

小肠中的免疫应答异常可驱动与多种免疫细胞类型相关的2型炎症反应。来自Immunity上发表的一项最新研究，发现在2型炎症反应下，肠道2型天然淋巴细胞（ILC2）显著增加，而胆碱乙酰转移酶+ 肠神经元产生的神经肽——α-CGRP在ILC2的稳态及应答中起到了关键调节作用，提示神经-免疫互作在肠道免疫稳态调节中的重要角色。

2型天然淋巴细胞 CGRP allergic inflammation batch effect correction intestinal immune cell atlas