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人类肠道菌群数据库

陈卫华+赵兴明+赫丽杰：实现疾病标志物识别和跨数据集比较的人类肠道菌群数据库GMrepo v2

GMrepo 是一个精心设计和一致注释的人类肠道宏基因组数据库，其主要目的是提高人类肠道宏基因组数据的可重用性和可访问性，并实现跨项目和表型比较。华中科技大学陈卫华、复旦大学赵兴明、中国医科大学人民医院赫丽杰作为共同通讯作者，在Nucleic Acids Research发表文章，介绍了 GMrepo 的更新版本GMrepo v2，在这个新版本中，作者收集了更多的项目、运行/样本和表型。最重要的是，作者添加了疾病标记识别和已识别标记的跨项目/表型比较。GMrepo v2 可在以下网址免费获得：https://gmrepo.humangut.info。

人类肠道菌群数据库疾病标志物宏基因组学测序表型

北林团队：理解肠道菌群内部结构功能关系的新模型

肠道菌群通过其复杂的内部相互作用决定人类健康，这是人类基因组编码的一个过程。然而，在这种高度密集的群落组合中对微生物的相互作用进行建模是一项重大挑战。北京林业大学邬荣领团队在Gut Microbes发表文章，绘制了微生物如何相互作用和共同工作以确定微生物群落行为的宿主遗传结构图，并进行路径分析来揭示基因型的直接影响，以及其通过微生物网络作为“内表型”对宿主表型的间接影响。本研究的模型提供了一种工具，可以潜在地用于了解肠道菌群内部结构功能关系的机制基础。

肠道菌群映射行为模型遗传图谱理论互作网络